秈型水稻地方品種、不育系和恢復(fù)系的遺傳多樣性.pdf

1、本研究選取均勻分布于水稻12條染色體上的38對SSR引物和24對SNP引物對24份秈稻地方品種、32份秈型不育系和45份秈型恢復(fù)系共101份水稻材料進(jìn)行遺傳多樣性分析,分析三者遺傳多樣性的差異,進(jìn)而為水稻雜種優(yōu)勢利用或雜交育種選育提供重要的理論依據(jù)。主要研究結(jié)果如下:
　　 1、在38個(gè)SSR位點(diǎn)上共檢測到了206個(gè)等位基因,平均每對SSR標(biāo)記檢測到了5.4個(gè)等位基因。在地方品種、不育系和恢復(fù)系中分別檢測到了135、128和14

2、8個(gè)等位基因,平均每對SSR引物檢測到的等位基因數(shù)分別為3.6、3.4和3.9個(gè)。地方品種、不育系和恢復(fù)系的Nei基因多樣性指數(shù)(He)分別為0.3340、0.3875和0.3783,多態(tài)信息含量(PIC)分別為0.3115、0.3518和0.3486,三者之間均無統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性差異。
　　 2、獲得了101份水稻材料24個(gè)基因位點(diǎn)總長為10712 bp的DNA序列,共發(fā)現(xiàn)了125個(gè)多樣性位點(diǎn),其中包括95個(gè)單堿基替換(SNP

3、s)、18個(gè)單基插入缺失和12個(gè)多堿基插入缺失。在地方品種、不育系和恢復(fù)系中分別發(fā)現(xiàn)了66、67和70個(gè)SNPs位點(diǎn),SNPs頻率(θw)分別為0.001650、0.001553和0.001494,三者之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性差異。
　　 95個(gè)SNPs位點(diǎn)構(gòu)成111種單倍型。地方品種、不育系和恢復(fù)系的單倍型基因多樣性分別為0.2897、0.3438和0.2954,三者之間無統(tǒng)計(jì)學(xué)上的顯著性差異。
　　 Nei基因多樣性指