云南水稻地方品種昆蟲小白谷重組近交系孕穗期耐冷性QTL定位.pdf

1、孕穗期冷害是高緯度稻區(qū)和高海拔稻區(qū)水稻生產(chǎn)中最主要的限制因子之一，其受多基因控制。本實驗以耐冷性極強云南地方品種昆明小白谷為父本，以耐冷性極弱品種十和田為母本，構(gòu)建了一個內(nèi)含225個株系的F14和F15代RIL群體，通過對該群體在2012年和2013年在云南麗江市(海拔2418m)、嵩明縣(海拔1915m)和彌勒縣(海拔1146m)三個地點進行1到2年的耐冷性鑒定，獲得其孕穗期耐冷性的直接評價指標（包括特定穎花結(jié)實率和單株結(jié)實率）和間接

2、評價指標（穗伸出度）的數(shù)據(jù)，并包含132個SSR分子標記覆蓋12對染色體的全基因組遺傳連鎖圖譜，完成了對水稻孕穗期耐冷性的QTL定位。主要研究結(jié)果如下:
　　1.構(gòu)建了一套包含分布在12條染色體132對SSR標記圖譜總長1891.58cM，相鄰分子標記的平均距離為14.33cM的水稻遺傳連鎖圖譜，經(jīng)與已發(fā)表的文獻對比，一致性良好。同時，檢測到37個分子標記偏離了1∶1的分離比，除了第4、5號染色體沒外的其余10條染色體上都有偏離標

3、記，并以第3號和7號染色體的偏離標記最多。絕大多數(shù)偏分離標記偏向昆明小白谷。
　　2.以單株結(jié)實率作為水稻孕穗期耐冷性鑒定指標，共得到與耐冷性相關(guān)的QTL8個，分別位于第2、3、6、8、10和11號染色體，所檢測的LOD值在2.10-5.19，對表型變異的貢獻率為4.01％-12.25％，其中，位于第8號染色體的qSF-8-2和位于第3號染色體的qSF-3對表型變異的貢獻率分別達到11.68％和12.25％，均大于10％。

4、　　3.以特定穎花結(jié)實率的作為水稻孕穗期耐冷性鑒定指標，共檢測到與耐冷性相關(guān)的QTL12個，分布于第1、2、3、6、7、8和11號染色體，LOD值在2.01-4.91，其解釋變異的貢獻率在4.35％-17.87％，qSSF-8-3能被多次檢測到，貢獻率分別為13.64％、9.80％和10.19％，為主效QTL基因。
　　4.以水稻穗伸出度作為水稻孕穗期耐冷性鑒定指標，共檢測到12個與水稻穗伸出度相關(guān)的QTL，分別分布于1、2、4、

5、6、7、9號染色體，LOD值在2.54-13.60，對表型的貢獻率在3.72％-22.17％，位于第1、6、7、9號染色體的qPE-1-1、qPE-1-2、qPE-6-2、qPE-7-1、qPE-7-2、qPE-9-2等6個QTLs，至少在兩種不同生長環(huán)境下均被檢測到，其中，qPE-7-1為主效基因。
　　qSF-10-1、qSSF-6、qSSF-8-3、qSSF-8-4、qPE-1-1、qPE-1-2、qPE-4、qPE-6-1

6、、qPE-7-1和qPE-9-2等9個QTL都是被多次（≥2）檢測到的。qSF-3、qSF-8-2、qSSF-2、qSSF-8-3、qPE-1-2、qPE-6-1和qPE-7-1在不同的生長環(huán)境下，最高的貢獻率均超過10％，其中，qSF-8-2和qSSF-8-3均位于第8號染色體RM5637-RM1345之間，且來源于昆明小白谷，推測同一QTL位點，該基因在直接評價體系中可被多次鑒定，且解釋變異率較高;而以間接評價指標得到的主效基因qP