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文檔簡介
1、人類基因組全序列測定的完成標志著后基因時代的到來,生命科學(xué)從基因組序列分析轉(zhuǎn)向基因功能的研究。蛋白質(zhì)組學(xué)是后基因時代研究中的重要組成部分,雙向凝膠圖像分析技術(shù)是蛋白質(zhì)組學(xué)研究的重要技術(shù),差異蛋白點提取和分析是雙向凝膠圖像分析技術(shù)的核心內(nèi)容,蛋白點匹配又是差異蛋白點提取的關(guān)鍵環(huán)節(jié)。蛋白點匹配算法可用于鑒定潛在差異蛋白質(zhì)分子,能夠為疾病診斷、藥物研制和環(huán)境污染分析提供依據(jù)。
本論文以凝膠電泳圖像蛋白點為研究對象,探索凝膠圖像間的蛋
2、白點匹配方法。主要研究工作、成果和創(chuàng)新點如下:
首先,介紹了蛋白組學(xué)的發(fā)展和主要關(guān)鍵技術(shù),概述了本課題的研究背景意義,綜述了凝膠圖像蛋白點匹配方法。
然后,通過添加 Landmark標記點和運用近鄰點機制,提出了基于Landmark的兩凝膠圖像間的蛋白點半自動匹配算法。算法通過采用Landmark區(qū)域劃分法和對應(yīng)區(qū)域和跨區(qū)域蛋白點匹配提高了算法精度,并從Landmark數(shù)目和圖源兩角度驗證了算法的有效性。但此方法為半
3、自動方法,需要人工介入。
其次,依據(jù)凝膠電泳圖像蛋白點的分布特征,提出了先特征蛋白點的粗匹配再兩圖像間蛋白點精匹配的自動匹配算法。首先采用統(tǒng)計學(xué)原理計算匹配距離閾值;然后采用區(qū)域劃分和相似性原理進行特征點提取及粗匹配;其次利用匹配到的特征點建立兩圖像間映射關(guān)系;最后實現(xiàn)兩圖像蛋白點間的精確匹配。通過真實凝膠圖像驗證了算法的有效性。
最后,從醫(yī)學(xué)分析效果角度,采用了先組內(nèi)兩兩匹配并生成合成膠,再合成膠蛋白點匹配的多幅凝
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