鵝ESRα基因SNPs分析及其與產(chǎn)蛋性能關(guān)系的研究.pdf

1、雌激素受體(estrogen receptor, ESR or ER)是核受體超家族成員之一,有ESRα、ESRβ和ESRγ三種亞型,它廣泛存在于各種動物體內(nèi)。雌激素通過與ESR結(jié)合調(diào)節(jié)靶組織的功能,能影響雌激素基因在雌性脊椎動物組織的表達(dá)與調(diào)控,從而對雌性繁殖周期中卵泡的生長發(fā)育發(fā)揮作用。 本研究采用候選基因法,以中國優(yōu)良中型鵝種皖西白鵝(n=200)作為試驗(yàn)材料,引入的萊茵鵝(n=80)作為對照材料。根據(jù)GenBank登錄的

2、雞ESRa基因序列(登錄號:NC006090),應(yīng)用DNAstar和Primer Premier 5.0軟件,設(shè)計(jì)了4對引物對皖西白鵝和萊茵鵝ESRα基因的外顯子1和外顯子4序列進(jìn)行克隆測序；采用PCR-SSCP方法檢測基因變異,以檢測鵝ESRα基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms, SNP)位點(diǎn),并分析ESRα基因多態(tài)性與皖西白鵝產(chǎn)蛋性狀的相關(guān)性。 實(shí)驗(yàn)結(jié)果：克隆出皖西白鵝和萊茵

3、鵝ESRα基因外顯子1和外顯子4序列(GenBank登錄號:EU266072、EU417675)。序列同源性比較分析表明,皖西白鵝ESRα外顯子1序列與萊茵鵝和家雞的同源性分別為99％和95％；外顯子4序列與萊茵鵝的完全相同,與家雞的同源性為96％。 系統(tǒng)進(jìn)化樹比較分析結(jié)果表明ESRα基因外顯子1在進(jìn)化過程中,硬骨魚類首先發(fā)生分支,哺乳類與禽類存在20bp堿基的差異,不同哺乳動物之間的核苷酸替代在10bp以內(nèi)；而鳥類之間鵝與雞的

4、核苷酸序列只有3bp左右的差異。 對皖西白鵝和萊茵鵝ESRα基因第1和4外顯子進(jìn)行多態(tài)性檢測,結(jié)果表明,外顯子4擴(kuò)增片段經(jīng)SSCP檢測不存在多態(tài)性,外顯子1發(fā)現(xiàn)有1個(gè)SNP位點(diǎn),即A105G,位于F1b引物的擴(kuò)增片段上。由一對等位基因A和B構(gòu)成,形成AA、AB和BB三種基因型。 群體遺傳分析表明,皖西白鵝F1b引物檢測的兩個(gè)等位基因,頻率分別為0.482和0.518;三種基因型(AA、AB和BB)頻率分別為0.190、0