陸地棉紅株突變Re基因的精細(xì)定位及表達(dá)分析.pdf

1、在棉花中，有關(guān)葉色基因的研究已有相關(guān)報(bào)道。對(duì)葉色突變體基因的定位有利于促進(jìn)分子標(biāo)記輔助育種在生產(chǎn)上的應(yīng)用，它也可以為基因的圖位克隆打下基礎(chǔ)。
　　本研究是在陸地棉鄂棉22(E22)和海島棉3-79的回交后代中(BC1S9)發(fā)現(xiàn)了紅株突變體，紅株基因暫時(shí)命名為Re。利用兩親本E22和BC1S9構(gòu)建F2分離群體。在F2分離群體中出現(xiàn)了紅株、中間型植株和綠株，且三種性狀的分離比符合孟德爾1∶2∶1的分離比。利用1898株F2隱性單株群體

2、為作圖群體對(duì)紅株突變體進(jìn)行精細(xì)定位與表達(dá)分析。主要結(jié)果如下:
　　1.在F2群體中挑選出10株典型紅株植株構(gòu)建紅株池，10株綠株構(gòu)建綠株池?；诒緦?shí)驗(yàn)室高密度的海陸種間圖譜，采用分子標(biāo)記技術(shù)，篩選到與紅株突變基因Re連鎖的標(biāo)記MON DC40065。在此基礎(chǔ)上，以雷蒙德氏棉為參考基因組分別開發(fā)了470個(gè)SSR標(biāo)記和126對(duì)UTR引物，以陸地棉為參考基因組開發(fā)了80個(gè)SSR標(biāo)記。利用BSA法對(duì)這些標(biāo)記進(jìn)行多態(tài)性的篩選，連鎖分析顯示共

3、有11個(gè)標(biāo)記與基因Re連鎖?；騌e位于D07染色體Chr01_8M-004和Gr01_9-13M_056之間，兩標(biāo)記的物理距離大約為1.5 Mb。
　　2.目標(biāo)區(qū)域內(nèi)包含88個(gè)基因。通過代謝途徑分析發(fā)現(xiàn)，與色素代謝途徑合成與轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)的基因共有5個(gè)，分別為RE1、RE2、RE3、RE4、RE5。對(duì)目標(biāo)區(qū)段內(nèi)基因在兩親本E22和BC1S11間進(jìn)行表達(dá)量分析，結(jié)果顯示，僅基因RE3在兩親本間表達(dá)量有差異，且差異是極顯著的。已有研究表明