RNAi醫(yī)學信息數據庫的研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、背景和目的: 作為新興的基因阻斷技術,越來越多的研究單位和公司都采用RNAi技術平臺來研究基因功能,篩選藥物或疾病的靶基因,核心進展是特定基因組RNAi文庫的建立,為我們能夠進行人類細胞的全基因組掃描奠定基礎,是一項具有重要實用使用價值的研究。 RNAi技術涉及多個學科的交叉,醫(yī)學,生物等相關領域的工作人員都可以利用RNAi技術進行研究工作,目前運用RNAi技術進行研究的工作正大量的成倍的增長,因此建立的RNAi信息數據

2、庫能使相關研究人員可以快捷、及時地獲得已通過RNAi沉默的基因和靶序列,這對相關人員就有非常大的意義。此外,還可以在互聯網上接受有關科研人員提交的相關基因研究信息,使數據庫更加豐富。 在數據庫操作系統(tǒng)選擇過程中,Linux下MYSQL+PHP建立的數據庫存在不直觀,數據類型不足,且對數據庫的修改操作過程復雜等缺點,為了使用戶可以方便、快捷地使用本數據庫,軟件設計采用了動態(tài)數據庫交互結構,外部用戶通過互聯網使用通用的瀏覽器就可以訪

3、問數據庫。 本實驗希望通過Windowssever2003下SQL2000+PHP構建一個WEB數據庫來實現特定基因組RNAi的資料搜集,將所有基因信息下載到本地數據庫中,人工搜索文獻并提交的方法更新數據庫。此法的優(yōu)點是可以自主、靈活地顯示數據庫的內容,并檢測其是否能提供最直接、最經濟和最有效地在特定基因組范圍內進行基因序列和功能篩選。 本研究的目的是建立一個較完整確切的已有文獻支持的RNAi相關醫(yī)學信息數據庫,并為以后

4、后續(xù)的研究打下基礎。 方法: 1.RNAi醫(yī)學數據庫的軟件開發(fā)平臺:包括windowsserver2003,Microsoftsqlserver2000,php5.1+ⅡS6,PHP腳本安裝運行過程三個部分。 2.RNAi醫(yī)學數據庫內部開發(fā):包括建立數據庫和數據表,數據庫的外部連接。 3.數據庫的外部應用:包括數據庫的登錄,提交數據庫界面,基因檢索界面三部分。 結果: 1.成功安裝wind

5、owsserver2003,Microsoftsqlserver2000,php5.1+ⅡS6,PHP三個軟件。 2.用SQLserver2000建立了RNAi數據庫,并用PHP設計瀏覽器端和服務器端的連接,使PHP與數據庫動態(tài)鏈接起來.再經過ⅡS6.0發(fā)布于internet之后,使用戶可以通過瀏覽器對數據庫進行訪問,添加,查詢等操作。 3.建立了可以同時顯示干擾基因,GeneTarget,PositionfromATG

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