利用中高度重復(fù)序列對栽培稻與幾個野生稻基因組的比較分析.pdf

1、1. 以栽培稻總DNA為探針對栽培稻(AA)自身，斑點野生稻(BB)以及藥用野生稻(CC)體細(xì)胞染色體進行基因組熒光原位雜交(GISH)，并以斑點野生稻總DNA為探針對自身和藥用野生稻體細(xì)胞染色體進行基因組熒光原位雜交，以此研究A、B、C 三個基因組型之間的關(guān)系。結(jié)果顯示A、B、C基因組之間的都存在較高的同源性，其中AA與CC之間的信號最強，BB基因組與AA基因組次之，BB基因組與CC基因組的信號最弱。說明A、B、C 三個基因組之間的親

2、緣關(guān)系，A與C最近，B與C最遠(yuǎn)。
　　 2. 用栽培稻，斑點野生稻，藥用野生稻的基因組C0t-1DNA分別對自身和藥用野生稻體細(xì)胞染色體進行熒光原位雜交。在同源染色體上呈現(xiàn)相似的C0t-1DNA雜交帶型, 并對其染色體進行了同源性聚類。A、B、C三個基因組C0t-1DNA在藥用野生稻上的雜交信號強度表明A和C的同源性較B和C更高，三個基因組的C0t-1DNA在藥用野生稻上的帶型也顯示出栽培稻與藥用野生稻的帶型更為保守，說明AA基

3、因組與CC基因組之間的親緣關(guān)系較近，而BB與CC基因組之間的親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。比較三個基因組的C0t-1DNA帶型還發(fā)現(xiàn)，端粒區(qū)的C0t-1DNA帶型保守，而在著絲粒，近著絲粒和異染色質(zhì)染色體臂上重復(fù)序列進化速度較快。同時，根據(jù)染色體形態(tài)及重復(fù)序列在染色體上的帶型對藥用野生稻染色體進行了核型分析。
　　 3. 以斑點野生稻(BB)總DNA做探針，未標(biāo)記的藥用野生稻(CC)總DNA封阻，通過16：1的封阻比例對非洲野生稻(BBCC)進

4、行熒光原位雜交，同時利用BB基因組的C0t-1DNA與非洲野生稻進行熒光原位雜交，結(jié)果顯示高濃度的封阻后，僅著絲粒有信號，說明在同源性較高的物種中，著絲粒序列都發(fā)生了變化。
　　 4 通過二倍體種BB的gDNA和C0t-1DNA作探針對斑點野生稻和非洲栽培稻進行熒光原位雜交，比較了重復(fù)序列含量分布以及核型的變化。證明非洲野生稻中的BB染色體組和CC染色體組的大小關(guān)系有悖于兩者自然狀態(tài)的二倍體組型的大小關(guān)系，據(jù)此推測植物在形成四倍