栽培稻秈粳亞種基因組的比較研究及藥用野生稻的比較核型分析.pdf

1、1.利用亞州栽培稻（Oryza sativa L.）的秈稻亞種“廣陸矮四號”（Oryza sativa ssp.indicacv Guangluai No.4）的基因組總DNA 作為探針，不同的洗脫嚴謹度條件下對自身和粳稻亞種“日本晴”（Oryza sativa ssp.japonica cv Nipponbare）進行基因組原位雜交（genomicin situ hybridization，GISH）分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，雜交信號在兩個亞種

2、染色體的分布相似，表明它們親緣關(guān)系較近。通過采用不同洗脫度，雜交信號出現(xiàn)明顯不同的帶型分布，尤其是在95％的洗脫嚴謹度下，秈稻和粳稻第1、7、8、9、11 染色體上的雜交信號帶型明顯不一致，說明即使在基因組親緣關(guān)系極近的亞種之間個別染色體同源性程度也較低。這幾條同源性相對比較低的染色體可能是進化中比較活躍的染色體，易于發(fā)生各種遺傳事件，是染色體組進化中的“先行者”，它們的變化可能最終導致了整個基因組水平上的差異并體現(xiàn)在亞種以及種間差異上

3、。 2. 利用同時分布在栽培稻(O. Sativa)和藥用野生稻(O. Officinalis)第9和第11 染色體上的緊密連鎖的RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)標記為探針，對藥用野生稻進行熒光原位雜交（fluorescence in situ hybridization，F(xiàn)ISH）。比較分析了栽培稻和藥用野生稻的第9和第11 染色體。結(jié)果發(fā)現(xiàn)，與藥用野生稻的常規(guī)核型分

4、析不同，本研究中所確定的藥用野生稻第9和第11 染色體不是遵循染色體長度隨染色體編號遞減的順序進行的，而是在比較分子遺傳圖基礎(chǔ)上結(jié)合染色體常規(guī)核型分析進行的，是比較基因組學細胞水平上的研究，有助于在同一個屬中對不同種作比較研究。 3.基于AA、CC基因組中高度重復序列C0t-1DNA 雜交帶型，對栽培稻、藥用野生稻進一步進行了比較核型分析，并構(gòu)建了相應的雜交帶型模式圖。研究發(fā)現(xiàn)栽培稻和藥用野生稻第9和第11 染色體著絲粒與端粒均