大足黑山羊與周邊黑山羊品種（群體）mtDNA D-loop序列多態(tài)性研究.pdf

1、中國是世界上家養(yǎng)動物品種資源最豐富的國家之一，據(jù)近年來有關(guān)專著和報道，我國現(xiàn)有山羊品種48個。然而，隨著外國高產(chǎn)家畜品種的不斷引進，雜交改良、人工授精、胚胎移植工作的深入展開，使的我國古老、土著家畜品種受到嚴(yán)酷競爭和排擠，造成地方品種群體數(shù)量急劇下降，甚至瀕臨滅絕。 在我國兩南地區(qū)，特別是四川盆地形成了具有濃郁地方特色的山羊品種(群體)。大足黑山羊群體是西南大學(xué)近年發(fā)現(xiàn)的一個具有高繁殖性能的黑山羊群體，其分布區(qū)的自然環(huán)境相對封閉

2、，與外界基因交流較少，可作為一個獨立的種群。為了保護和利用好這一遺傳資源，課題組對大足黑山羊及周邊地區(qū)幾個黑山羊品種(群體)的遺傳多樣性進行了基礎(chǔ)研究。 本研究利用mtDNA D-loop分子標(biāo)記對川、渝、滇三地的5個黑山羊品種或群體(大足黑山羊、川東黑山羊、營山黑山羊、樂至黑山羊、圭山黑山羊)，共計86個個體進行遺傳多樣性分析。結(jié)合GenBank上的山羊mtDNA全序列，采用軟件DNAMAN、BioEdit、ClustalW、

3、MEGA4.0、DNASP對其進行了遺傳多樣性進化分析。通過計算遺傳雜合度、多態(tài)信息含量、NEI氏遺傳距離，分別用非加權(quán)配對算術(shù)平均法聚類分析和鄰近結(jié)合法，分析品種(群體)之間的遺傳變異情況。結(jié)果表明： 1.測試黑山羊品種(群體)mtDNA片段長度16kb左右，mtDNA D-loop片段長度為1210～1214 bp，5個黑山羊群體之間mtDNA D-loop區(qū)的部分序列中A、T、G、C含量沒有明顯的差別，變異堿基只要集中在4

4、00～850bp之間，在650bp處左右變異最為集中。越是伸向兩端，堿基變異越少，各品種堿基組成A+T(約60％)遠(yuǎn)大于C+G(約40％)； 2.從總體上看，5個黑山羊品種均具有豐富的單倍型，共檢測劍50個單倍型，群體間共有多態(tài)位點311個，其中，單一多態(tài)位點82個，簡約信息位點229個，單倍型多樣度(Hd)為0.91912～1.00000，核苷酸多樣度(Pi(p))為0.01455-0.02171，多態(tài)位點數(shù)12.86％～29

5、.58％：D-loop序列多樣性較豐富。 3.在5個研究的黑山羊群體中，樂至黑山羊群體內(nèi)的遺傳距離(0.0223±0.0028)遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于其余4個群體，與群體總的平均遺傳距離接近(0.0210±0.0028)。營山黑山羊是所研究的5個黑山羊群體中，群體內(nèi)遺傳距離最小的群體(0.0149±0.0026)。 4.對5個黑山羊品種(群體)基于Da值、Dxy值進行聚類分析，川東黑山羊與營山黑山羊首先聚在一起，說明它們間的親緣關(guān)系較