苧麻纖維細度關聯(lián)分析.pdf

1、本研究利用93對多態(tài)性SSR引物對104份苧麻核心種質(zhì)進行全基因組多態(tài)性位點掃描，在其三季麻混合樣纖維細度得到精細測量的基礎上，對苧麻的群體結構進行分析，同時利用關聯(lián)分析的方法，獲得了與纖維細度顯著關聯(lián)的位點，為今后篩選優(yōu)良種質(zhì)、基因定位和克隆以及分子標記輔助育種打下基礎。主要結果如下:
　　1.利用93對SSR引物在104份苧麻核心種質(zhì)中擴增出255個位點，多態(tài)性很高，這104份核心種質(zhì)遺傳多樣性豐富;
　　2.根據(jù)基于遺

2、傳相似系數(shù)的UPGMA聚類法、PCA主坐標分析法和Structure軟件的后驗概率對數(shù)模型的群體結構分析法對群體分層分析發(fā)現(xiàn)，104個苧麻核心種質(zhì)分為明顯的兩大類，而又可細分為6個亞類;
　　3.試驗共得到93個標記的4278個組合，當P＜0.05時，348個位點組合處于LD，占總位點組合數(shù)的8.13％;當P＜0.01時，僅102個位點處于LD，占總位點組合數(shù)的2.4％;按R2的范圍，R2＞0.01的位點組合有2583個，占總位點

3、組合數(shù)的60.4％;R2＞0.05的位點組合有127個，占總位點組合數(shù)的3.0％;R2＞0.1的位點組合有11個，占總位點組合數(shù)的0.25％;
　　4.本研究通過K=2和K=6的Q+K+MLM和PCA+K+MLM分析模型共同定位消除假陽性關聯(lián)，在P＜0.05的顯著性水平，最終得到了RAM0298、b38和b64等3個與纖維細度顯著相關的分子標記。并且3個關聯(lián)標記對表型變異解釋率都在5％以上，其中RAM0298在3個分析模型中對表型