毛蚶群體遺傳學(xué)研究.pdf

1、毛蚶（Scapharca kagoshimensis）是廣泛分布在西北太平洋近海的埋棲型貝類，具有較高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值，一直是我國(guó)傳統(tǒng)的漁業(yè)捕撈對(duì)象。由于在很長(zhǎng)一段時(shí)間內(nèi)，我國(guó)毛蚶的資源量相對(duì)比較豐富，對(duì)于毛蚶群體遺傳學(xué)方面的研究遲遲沒(méi)有得到關(guān)注。但隨著中國(guó)近年來(lái)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展以及城市現(xiàn)代化的推進(jìn)，沿岸生態(tài)系統(tǒng)以及淺海貝類的棲息環(huán)境均受到了較大的挑戰(zhàn)，保護(hù)漁業(yè)對(duì)象的自然資源，已經(jīng)成為了一個(gè)較為緊迫的議題。毛蚶的人工育苗和養(yǎng)殖生產(chǎn)在我國(guó)已經(jīng)開(kāi)展了一

2、段時(shí)間，人工繁育群體的遺傳多樣性是否降低也逐漸成為一個(gè)備受關(guān)注的問(wèn)題。此外，為了更好的在育苗生成過(guò)程中做到有的放矢，借助分子生物學(xué)的技術(shù)手段，研究苗種繁育過(guò)程中有效繁殖群體的大小，親代和子代之間遺傳多樣性的變化以及近交系數(shù)，對(duì)于今后健康苗種培育，推動(dòng)毛蚶養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)具有重要的指導(dǎo)意義。為此，本研究開(kāi)展了如下幾方面的工作:
　　1.毛蚶微衛(wèi)星標(biāo)記開(kāi)發(fā)及其在家系分析中的應(yīng)用
　　首先，利用磁珠富集法，構(gòu)建微衛(wèi)星富集文庫(kù)，從中挑選了1

3、96個(gè)克隆用于測(cè)序，得到41個(gè)具備多態(tài)性的微衛(wèi)星位點(diǎn)。根據(jù)位點(diǎn)等位基因的范圍，引物的退火溫度以及反應(yīng)條件等要素，從41個(gè)位點(diǎn)中篩選出20個(gè)，成功開(kāi)發(fā)出7組微衛(wèi)星多元PCR體系。利用TP-M13-SSR技術(shù)，對(duì)這些標(biāo)記進(jìn)行群體分析，結(jié)果顯示位點(diǎn)的等位基因范圍為5-26，位點(diǎn)的平均等位基因數(shù)為15.2。期望雜合度和觀測(cè)雜合度的范圍分別為0.733-0.960和0.563-0.886。經(jīng)過(guò)序列化的Bonferroni校正后，共有兩個(gè)位點(diǎn)偏離哈

4、迪-溫伯格平衡，所有位點(diǎn)中均未檢測(cè)出連鎖不平衡。
　　2.毛蚶地理群體遺傳學(xué)研究
　　使用線粒體COI序列標(biāo)記，檢測(cè)了我國(guó)近海海域12個(gè)毛蚶地理群體的群體遺傳結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)以長(zhǎng)江口為界毛蚶地理群體存在兩個(gè)進(jìn)化顯著單元(ESU)，這兩個(gè)ESU之間具有顯著的遺傳差異，每一個(gè)ESU又可被進(jìn)一步分為兩個(gè)次單倍型群。兩兩配對(duì)ΦST及IBDW分析結(jié)果顯示，毛蚶地理群體呈現(xiàn)大而顯著的群體遺傳結(jié)構(gòu)模式，并存在顯著的距離遺傳模式。這些證據(jù)

5、表明，目前我國(guó)沿海毛蚶自然種群的遺傳格局，主要是歷史因素造成的，各個(gè)譜系之間已經(jīng)形成了較為深刻的遺傳分化。長(zhǎng)江河口的淡水流入，可能是阻斷毛蚶自然種群之間的基因流并長(zhǎng)久維持這種歷史格局的的主要因素。
　　3.毛蚶養(yǎng)殖和野生群體遺傳多樣性比較研究
　　使用10個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記，選擇毛蚶的5個(gè)養(yǎng)殖群體以及2個(gè)野生群體的開(kāi)展了相關(guān)的研究。研究結(jié)果表明，同野生群體相比，養(yǎng)殖群體并沒(méi)有出現(xiàn)顯著的遺傳多樣性水平的下降。FsT檢驗(yàn)結(jié)果以及遺傳距

6、離(DC)計(jì)算結(jié)果，均顯示養(yǎng)殖群體和野生群體之間存在較為顯著的遺傳分化，在養(yǎng)殖群體內(nèi)部不同地域的群體，在遺傳結(jié)構(gòu)上也出現(xiàn)了顯著的分化。這些研究結(jié)果表明，采用大數(shù)目的親本繁殖規(guī)?？赡苁鞘沟妹鲤B(yǎng)殖群體遺傳多樣性得以維系的主要原因之一。
　　4.毛蚶養(yǎng)殖群體有效繁殖群體的研究
　　使用8個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)一個(gè)8雄7雌的毛蚶混交家系進(jìn)行分析，比較了親本和子代的遺傳多樣性變化，以此來(lái)推斷毛蚶的有效繁殖群體大小。研究結(jié)果顯示，親本和子代的