小麥抽穗期TaHdM605精細(xì)作圖.pdf

1、適宜的抽穗期是保證作物高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)的重要前提，因此挖掘抽穗期相關(guān)基因并對(duì)其功能進(jìn)行解析，不但可以為培育具有適應(yīng)不同生態(tài)環(huán)境的小麥新品種提供候選基因，而且可以增加對(duì)小麥抽穗調(diào)控機(jī)理的理解和認(rèn)識(shí)。小麥抽穗期突變體M605是從小麥偃展4110(YZ4110)EMS突變體庫(kù)中篩選出的一個(gè)特晚抽穗的突變體，其攜帶一隱性基因TaHdM605。我們前期的研究已將TaHdM605定位于小麥3DL染色體上?；虻木?xì)作圖是基因圖位克隆的基石。本文利用小麥基因

2、組序列信息及比較基因組學(xué)的原理對(duì)小麥抽穗期基因TaHdM605所在區(qū)段進(jìn)行了共線性分析，利用序列比對(duì)分析的結(jié)果開發(fā)了大量新的分子標(biāo)記，繪制了小麥抽穗期基因TaHdM605精細(xì)遺傳圖譜。
　　利用TaHdM605兩側(cè)的分子標(biāo)記barc42和cfd152的序列分別BLAST水稻、高粱、大麥和短柄草的基因組序列，通過(guò)序列的比對(duì)分析，將TaHdM605基因鎖定在水稻的LOC_Os01g66190-LOC_Os01 g67360、高粱Sb0

3、3g042010-Sb03g042770、大麥3H染色體480Mb-510Mb和短柄草Bradi2g57170-Bradi2g57710區(qū)間內(nèi)，共線性分析表明該區(qū)段在不同物種中具有比較好的共線性關(guān)系。通過(guò)序列的比對(duì)分析，在此區(qū)間內(nèi)共開發(fā)了1046對(duì)SSR分子標(biāo)記，發(fā)現(xiàn)8對(duì)連鎖的分子標(biāo)記，其中最近的分子標(biāo)記M310距離目標(biāo)基因0.8cM。利用新近發(fā)表的小麥中國(guó)春3B染色體序列和粗山羊草基因組序列草圖又開發(fā)了766對(duì)對(duì)新的SSR分子標(biāo)記，發(fā)

4、現(xiàn)13對(duì)連鎖的分子標(biāo)記，其中最近分子標(biāo)記M35與目標(biāo)基因共分離。利用新開發(fā)的連鎖標(biāo)記，在大的作圖群體(3228個(gè)F2單株和1468個(gè)選自次級(jí)分離群體的隱性純合單株)中對(duì)TaHdM605進(jìn)行了精細(xì)遺傳作圖，最終將抽穗期基因TaHdM605定位于分子標(biāo)記M310和M27之間，其中，M35與目標(biāo)基因共分離，M310有2個(gè)重組單株，M27有1個(gè)重組單株。
　　通過(guò)對(duì)共分離標(biāo)記M35所在scaffold1510和側(cè)翼scaffolds序列中

5、基因及重復(fù)序列的詳細(xì)分析，從中選擇15個(gè)預(yù)測(cè)基因用于SNP標(biāo)記的開發(fā)，共獲得16個(gè)連鎖SNP位點(diǎn)，目前正在對(duì)這些SNP位點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證。
　　此外，利用本室已發(fā)表的粗山羊草高密度遺傳圖，并結(jié)合對(duì)該作圖群體抽穗期表型的調(diào)查數(shù)據(jù)，在粗山羊草7D染色體bin77-bin78區(qū)間內(nèi)定位了一個(gè)控制抽穗期的主效QTL，該QTL貢獻(xiàn)率為21.73％。通過(guò)bin77-bin78區(qū)段與水稻基因組序列的比對(duì)分析，發(fā)現(xiàn)該區(qū)段在兩物種中的共線性非常差，因此進(jìn)