中國(guó)水牛遺傳多樣性與母系起源研究.pdf

1、我國(guó)水牛有著7000多年的馴化和選擇歷史，在分類(lèi)學(xué)上屬于沼澤型水牛，具有豐富的遺傳資源。由于對(duì)我國(guó)地方水牛類(lèi)群的遺傳多樣性及遺傳特性缺乏全面和系統(tǒng)的認(rèn)識(shí)，其利用方式往往只限于作為母本，用外來(lái)品種作為父本進(jìn)行雜交改良，導(dǎo)致我國(guó)某些地方水牛類(lèi)群的遺傳多樣性逐漸下降、甚至出現(xiàn)某些類(lèi)群的遺傳資源已近滅絕。但對(duì)我國(guó)水牛的起源進(jìn)化及遺傳多樣性研究還不夠全面和深入，為了更好的保護(hù)和利用我國(guó)珍貴的地方水牛類(lèi)群的遺傳資源，本研究對(duì)我國(guó)22個(gè)水牛類(lèi)群共45

2、5個(gè)個(gè)體mtDNAD-loop區(qū)全序列進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，研究中國(guó)水牛的母系起源、類(lèi)群之間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系及遺傳多樣性，得到如下結(jié)果： 1.中國(guó)22個(gè)水牛類(lèi)群455個(gè)個(gè)體mtDNA D-loop區(qū)全序列長(zhǎng)度為894 bp～920 bp，最常見(jiàn)的為916bp，長(zhǎng)度多態(tài)性是由于全序列中存在三個(gè)較為特異的polyG/C造成的。 2.檢測(cè)到148種單倍型114個(gè)核苷酸多態(tài)位點(diǎn)，約占所測(cè)核苷酸總長(zhǎng)的12.36％，97個(gè)轉(zhuǎn)換，12個(gè)顛換，5

3、個(gè)轉(zhuǎn)換與顛換共存，顯示出堿基替換有明顯的偏倚。其單倍型多樣度(H)為0.4000士0.2373～1.0000士O．1265；核苷酸多樣度(π值)為0.0070士0.0 039～0.0219士0.0116，表明中國(guó)水牛具有豐富的遺傳多樣性。 3.mtDNA D-loop序列的NJ系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)和網(wǎng)絡(luò)分析表明，中國(guó)沼澤型水牛具有兩大支系，即支系A(chǔ)和支系B，支持中國(guó)水牛有2個(gè)母系起源的觀點(diǎn)。支系B又可分為兩個(gè)亞支，本研究首次命名為亞支B1

4、和亞支B2。 4.我國(guó)22個(gè)地方水牛類(lèi)群間沒(méi)有明顯的群體結(jié)構(gòu)。中國(guó)水牛各類(lèi)群間都包含有兩個(gè)主要的母系起源支系，類(lèi)群間遺傳分化不明顯，但是支系內(nèi)、群體間差異顯著，但分化較小，同時(shí)支系B的分化程度較A支系較大，為較為古老的一支。 5.對(duì)中國(guó)水牛兩個(gè)支系的所有個(gè)體分別進(jìn)行不配對(duì)分析，發(fā)現(xiàn)支系A(chǔ)表現(xiàn)線性降低的不配對(duì)分布，支系B分布曲線表現(xiàn)光滑的正態(tài)分布曲線，且亞支系B2及亞支系B1分布曲線均呈單峰型，F(xiàn)s值分別為-26.32，-