不同煙草品種間花期相關基因的分子差異分析.pdf

1、煙草是我國重要的經(jīng)濟作物，早花對其產(chǎn)量和質量有較大的影響。在植物開花的光周期途徑中，CO和FT是兩個重要的調控基因。CO基因通過感受外界光條件誘導下游基因FT的表達，從而促進植物開花。云煙85、云煙97和興煙1號3個煙草品種親緣相近卻有著不同的花期。研究CO和FT的同源基因在云煙85、云煙97和興煙1號3個近緣品種間的分子差異，有助于揭示三者間的不同花期調控機理，為進一步利用基因工程改良品種提供分子依據(jù)。本文設計擴增引物COF和COR以

2、及擴增引物FTF和FTR，從3個品種的基因組DNA中克隆了CO同源基因和FT同源基因，并對其基因序列及相應的氨基酸序列進行同源對比、進化樹分析和蛋白保守結構域的分析。得到的主要結果如下:
　　(1)利用14對SSR核心引物通過SSR-PCR鑒定了云煙85、云煙97和興煙1號3個煙草品種的親緣關系。
　　(2)利用PCR技術從3個品種的基因組DNA中克隆了三者的CO同源基因和FT同源基因，并分別命名為Yunyan85 CO、Y

3、uanyan97 COa、Yunyan97 COb、Yuanyan97 COc、Xingyan No.1COa和XingyanNo.1COb，其中除了Yunyan85 CO基因大小為1534bp外，其他5個基因大小均1531bp;將3個品種FT同源基因分別命名為Yunyan85 FTa、Yunyan85 FTb、Yuanyan97 Fa、Yunyan97 FTb、Xingyan No.1FTa、XingyanNo.1FTb和Xingya

4、nNo.1FTc，除Yuanyan97 FTa基因大小為1407外，其他6個基因大小均為1409bp。
　　(3)通過分析克隆所得的3個品種的CO同源基因和FT同源基因，依據(jù)NCBI數(shù)據(jù)庫相應基因的編碼序列——NtCO基因(GenBank ID:JQ686941)以及Ntomentosiformis FT1基因(GenBank ID: KC485968)，鑒定它們的內含子和外顯子，并推導出對應的氨基酸序列。推導出的氨基酸序列的同源

5、比對顯示，Yunyan85CO基因對應的氨基酸與其他2個品種CO同源基因對應氨基酸相比，出現(xiàn)了18處氨基酸突變。Yuanyan97 COa和Yunyan97 COb基因對應的氨基酸與其他基因對應氨基酸相比，出現(xiàn)了3處氨基酸突變。XingyanNo.1 COa基因對應的氨基酸與其他基因對應氨基酸相比，出現(xiàn)了3處氨基酸突變。Yuanyan97 COc基因對應的氨基酸與其他基因對應氨基酸相比，出現(xiàn)了1處氨基酸突變。Xingyan No.1FT

6、a基因對應的氨基酸與其他2個品種FT同源基因對應氨基酸相比，出現(xiàn)了2處氨基酸突變。
　　(4)用NCBI中CD-search(Conserved Domains search)分析3個品種CO同源基因、FT同源基因對應的氨基酸序列發(fā)現(xiàn):3個品種的CO同源基因對應的氨基酸序列在氨基端有2個BBOX，在羧基端有1個CCT; FT同源基因對應的氨基酸序列均有FT基因家族共有的PEPB同源結構。
　　(5)將克隆出的基因所對應的氨基