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1、主要組織相容性復(fù)合體(:Majior histocopitibility complex,MHC)指集中于某一染色體、編碼與免疫應(yīng)答直接相關(guān)的一類細(xì)胞膜糖蛋白基因群。其功能不僅限于移植排斥反應(yīng),它還與機(jī)體對(duì)外源性抗原的免疫應(yīng)答之間存在關(guān)聯(lián)。主要組織相容性復(fù)合物是目前已知多態(tài)性最豐富的基因系統(tǒng),本研究主要對(duì)186頭6品種小型豬的SLAⅡ類基因DQB和98頭3品種小型豬的SLAⅡ類基因.DRB的外顯子2進(jìn)行了PCR-RFLP酶切分型,擴(kuò)增片
2、段包含部分第1內(nèi)含子、完整第2外顯子及部分第2內(nèi)含子,DQB為326b0、DRB為311bp,同時(shí)本研究對(duì)這兩個(gè)基因的擴(kuò)增片段進(jìn)行了克隆測(cè)序,并進(jìn)行群體的遺傳結(jié)構(gòu)分析和進(jìn)化分析,結(jié)果如下: 采用Rsa I和Hinf I兩種限制性內(nèi)切酶對(duì)甘孜藏豬、合作豬、滇南小耳豬、巴馬小型豬、五指山豬和荷包豬6個(gè)品種的186頭個(gè)體進(jìn)行了SLA-DQB基因的PCR-RFLP分型;SLA-DQB片段經(jīng)Rsa I酶切得到5種等位基因,14種基因型(C
3、C、DD、GG、FF、CD、CG、CE、CF、DG、DE、DF、GE、GF、EF),各個(gè)豬種中的基因型分布在5~10種之間,6個(gè)豬群的雜合度(He)在0.5384~0.7288之間,且華北型(0.7288)>華南型(0.7161)>高原型(0.6913),巴馬小型豬的PIC值(0.4884)略小于0.5,偏向于高度多態(tài),其它5個(gè)群體的:PIC值在0.5712~0.7285之間,均大于0.5,表現(xiàn)為高度多態(tài);經(jīng)卡方適合性檢驗(yàn):甘孜藏豬,巴
4、馬小型豬和五指山豬的卡方適合性檢驗(yàn)值均低于顯著水平(P>0.05),達(dá)到了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。合作豬,滇南小耳豬和荷包豬在該位點(diǎn)均未達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài);經(jīng)Hinf I酶酶切,得到了3種等位基因,6種基因型(HH、II、JJ、HI、HJ、U),He在不同的生態(tài)類型豬種中的分布為:華北型(0.5238)>高原型(0.4350)>華南型(0.4286),PIC值在0.2908~0.4610之間,在該位點(diǎn)
5、表現(xiàn)為中度多態(tài)。在不同的生態(tài)類型中,其PIC值大小依次為:華北型>華南型>高原型,經(jīng)卡方適合性檢驗(yàn),甘孜藏豬,滇南小耳豬,巴馬小型豬,荷包豬的卡方適合性檢驗(yàn)值均低于顯著水平(P>0.05),達(dá)到了Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。合作豬,五指山豬在該位點(diǎn)未達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)。 SLA.DRB片段經(jīng).RsaI酶酶切,得到了5種等位基因(R、S、T、U、V),9種基因型,三個(gè)群體中,S是優(yōu)勢(shì)等位基因(0.6
6、786),V為劣勢(shì)等位基因(0.0562),PIC值大小依次為:合作豬(0.5875)>五指山豬(0.4780)>荷包豬(0.3314);:He值的大小依次為:合作豬(0.6306)>五指山豬(0.5122)>荷包豬(0.3448);經(jīng)卡方適合性檢驗(yàn),合作豬卡方值低于顯著水平(P>0.05),達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),五指山豬,荷包豬沒(méi)有達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài);經(jīng)MspI酶酶切,得到了兩種等位基因,3種
7、基因型(PP、QQ、PQ),Q為優(yōu)勢(shì)等位基因(0.5918),P為劣勢(shì)等位基因(0.4082),PIC值大小依次為:荷包豬(0.3713)>合作者(O.3680)>五指山(0.3579)。He值的大小依次為:荷包豬(0.4927)>合作豬(0.4861)>五指山(0.4669),經(jīng)卡方適合性檢驗(yàn),合作豬,五指山豬和整個(gè)群體的卡方檢驗(yàn)值均低于顯著水平(P>0.05),在MspI位點(diǎn)達(dá)到Hardy-Weinberg平衡狀態(tài),荷包豬沒(méi)有達(dá)到H
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