水稻直立穗型基因的分子標記定位.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、利用微衛(wèi)星(simple sequence repeat，SSR)分子標記技術(shù)，結(jié)合基于分離群體分析法(bulked-segregant analysis，BSA)的隱性群體分析法(reccesive-class analysis，RCA)，對含有目的基因的直立穗親本的TC1F1和F22個群體的95個直立穗個體和608個彎穗個體進行了連鎖分析。獲得了兩個位于第9染色體上的候選連鎖標記RM107和RM566。遺傳距離分別為14.4cM和1

2、1.5cM，并且位于該目的基因的兩側(cè)。為了確認這個結(jié)果，又在RM107和RM566之間選取了16個在直彎親本間有多態(tài)性的微衛(wèi)星標記RM434，RM1189，RM7048，RM3600，RM410，RM242，RM278，RM201，CYZ-4，CYZ-5，CYZ-6，CYZ-10，CYZ-11和CYZ-12進行了連鎖分析。研究表明：Ep1(t)位點被界定在側(cè)翼標記CYZ-6和CYZ-11之間0.14cM的遺傳區(qū)域，另外1個標記CYZ-1

3、2則與Ep1(t)位點完全共分離。
　　 為了構(gòu)建Ep1(t)位點的物理圖，把與Ep1(t)基因連鎖的標記都通過BIA方法著陸于上述參考序列上，并由此構(gòu)建了該目的基因位點的重疊群。由參考序列可以推測Ep1(t)位點被界定于側(cè)翼標記CYZ-6和CYZ-11之間43kb的范圍內(nèi)。進一步通過BIA分析，確認了在該區(qū)域內(nèi)具有8個開放閱讀框。
　　 本研究為目的基因Ep1(t)的最終克隆奠定了很好的基礎，同時也可把與目的基因Ep1

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