利用外部信息進(jìn)行中國西門塔爾牛遺傳評定研究.pdf

1、在畜禽遺傳評定中，數(shù)據(jù)資料和計(jì)算方法是影響遺傳評定效果的主要因素。在牛的后裔測定工作中，一頭公牛不同后代的數(shù)據(jù)往往被提交到不同的遺傳評定中心，由于各遺傳評定中心所利用的后代資料不同，采用的遺傳評定方法各異，所得到的育種值估計(jì)準(zhǔn)確性及公牛排序也各不相同。但受地域、品種等因素限制，要想獲得一頭公牛所有后代數(shù)據(jù)是難以實(shí)現(xiàn)的。因此，有學(xué)者提出利用外部信息(某群體中部分個(gè)體在其它群體中的估計(jì)育種值及其準(zhǔn)確性)提高內(nèi)部個(gè)體遺傳評定準(zhǔn)確性的方法，這種

2、方法的顯著優(yōu)點(diǎn)在于它所需要的信息容易獲得。在每次遺傳評定結(jié)束后，相關(guān)機(jī)構(gòu)都要公布遺傳評定結(jié)果(育種值及其遺傳評定準(zhǔn)確性)，這給利用外部信息進(jìn)行遺傳評定提供了數(shù)據(jù)資料。 本研究在Henderson(1975)的基礎(chǔ)上，以貝葉斯理論為依據(jù)，推導(dǎo)了利用外部信息進(jìn)行內(nèi)部個(gè)體育種值估計(jì)的計(jì)算過程。運(yùn)用MATLAB語言編寫了EXTSIM程序，模擬在不同情況下利用外部信息進(jìn)行育種值估計(jì)的效果。結(jié)果表明：應(yīng)用外部信息可以分別提高內(nèi)部和外部個(gè)體育

3、種值估計(jì)的準(zhǔn)確性，提高的程度與外部公牛育種值估計(jì)準(zhǔn)確性呈正相關(guān)；若用internal表示內(nèi)部數(shù)據(jù)，external表示外部數(shù)據(jù)，incorporative表示包括外部信息的內(nèi)部數(shù)據(jù)，joint表示內(nèi)、外合并數(shù)據(jù)，對于共同個(gè)體而言，采用這四種不同方法所得到的育種值估計(jì)準(zhǔn)確性排序依次為：incorporative>joint>external>internal；incorporative方法的估計(jì)育種值與joint方法的估計(jì)育種值間相關(guān)系數(shù)

4、為0.99。因此可以說，只利用外部個(gè)體的育種值以及育種值估計(jì)準(zhǔn)確性就可以得到與合并內(nèi)外數(shù)據(jù)相近的結(jié)果。 通過對中國西門塔爾牛出生重、斷奶重和周歲重三個(gè)性狀進(jìn)行遺傳分析，發(fā)現(xiàn)中國西門塔爾牛數(shù)據(jù)量小、數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)不合理是影響遺傳參數(shù)和育種值估計(jì)準(zhǔn)確性的關(guān)鍵問題。 由于中國西門塔爾牛與美國西門塔爾牛存在一定的親緣聯(lián)系，而且，美國西門塔爾牛有完善的生產(chǎn)性能測定體系和較高的育種值估計(jì)準(zhǔn)確性。 因此，本研究以中國西門塔爾牛為內(nèi)部

5、數(shù)據(jù)，以美國西門塔爾牛為外部數(shù)據(jù)，以出生重、斷奶重、周歲重、泌乳力和母體斷奶重為研究對象，以joint結(jié)果作為評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)，通過external、internal、incorporative與joint估計(jì)育種值的相關(guān)關(guān)系分析不同方法對兩國間的共同個(gè)體(22頭公牛)以及共同個(gè)體以外的其它個(gè)體育種值估計(jì)的影響。 結(jié)果表明： 對兩國間共同個(gè)體，利用外部信息可以明顯提高其在內(nèi)部數(shù)據(jù)中的遺傳評定準(zhǔn)確性，不同性狀internal結(jié)果與

6、joint結(jié)果的平均相關(guān)系數(shù)為0.36，而incorporative結(jié)果與joint結(jié)果的平均相關(guān)系數(shù)上升到0.92。 與模擬結(jié)果不同的是，external結(jié)果與joint結(jié)果的相關(guān)系數(shù)最高，各性狀均在0.99以上，這主要是因?yàn)槊绹鏖T塔爾牛數(shù)據(jù)量非常大(5,955,372個(gè)個(gè)體)，中國僅3139個(gè)，當(dāng)合并兩國數(shù)據(jù)后，中國的數(shù)據(jù)對美國西門塔爾牛育種值估計(jì)幾乎沒有任何影響；對中國西門塔爾牛數(shù)據(jù)庫中的其它個(gè)體來說，采用incorpo