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文檔簡(jiǎn)介
1、圓筒吻鮈(Rhinogobio cylindricus)是長(zhǎng)江中上游及其支流的特有魚類。近年來,隨著水電工程、環(huán)境污染、過度捕撈、外來物種入侵等多因素的干擾,使水生生物多樣性面臨巨大的挑戰(zhàn)。三峽大壩蓄水水位的不斷提高,向家壩水利工程的投入使用,都嚴(yán)重影響長(zhǎng)江上游魚類的棲息地和生物量,圓筒吻鮈的群體數(shù)量也相應(yīng)減少。為了對(duì)圓筒吻鮈的生物資源提供有效保護(hù),必須對(duì)其遺傳結(jié)構(gòu)有充分的了解。本文采用兩種分子標(biāo)記(線粒體DNA分子標(biāo)記和微衛(wèi)星標(biāo)記)探
2、討長(zhǎng)江上游宜賓(YB)、萬州(WZ)、江滓(JJ)和合江(HJ)四個(gè)圓筒吻鮈群體的遺傳結(jié)構(gòu)。研究結(jié)果主要如下:
(1)分析了122尾圓筒吻鮈的線粒體Cytb序列,共檢測(cè)出22個(gè)單倍型,62個(gè)變異位點(diǎn),圓筒吻鮈種群平均單倍型多樣性指數(shù)為0.716,平均核苷酸多樣性指數(shù)為0.01006,單倍型多樣性指數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)最高的均為宜賓群體。分析112尾圓筒吻鮈的控制區(qū)序列,共檢測(cè)出30個(gè)單倍型,60個(gè)變異位點(diǎn),平均單倍型多樣性指數(shù)
3、為0.840,其中單倍型多樣性最高的為宜賓群體,平均核苷酸多樣性指數(shù)為0.01278,核苷酸多樣性指數(shù)最高的為萬州群體。合江(HJ)群體中,可能由于樣本數(shù)量較少,導(dǎo)致兩種線粒體分子標(biāo)記中Hd指數(shù)與π指數(shù)都相對(duì)偏低。
(2)構(gòu)建的單倍型網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)圖和單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹均顯示圓筒吻鮈的單倍型分布與地理位置沒有明確的相關(guān)性。對(duì)Cyt b序列和控制區(qū)數(shù)據(jù)進(jìn)行分子變異方差分析(AMOVA),結(jié)果表明群體間遺傳分化很小,變異主要存在于群體內(nèi)。
4、兩種分子標(biāo)記的群體固定分化指數(shù)Fst均為負(fù)值,表明4個(gè)群體間呈低度分化。
(3)分別以Cyt b序列和控制區(qū)序列數(shù)據(jù)進(jìn)行錯(cuò)配分布分析、Tajima's D和Fu's Fs檢驗(yàn)圓筒吻鮈4個(gè)種群的歷史變動(dòng),結(jié)果均顯示圓筒吻鮈未經(jīng)歷過種群擴(kuò)張。
(4)利用9個(gè)微衛(wèi)星座位分別分析宜賓(YB)、萬州(WZ)、江津(JJ)和合江(HJ)四個(gè)群體,等位基因數(shù)介于6.8889(HJ)~14.0000(JJ)之間,平均值為10.333
5、3,基因豐富度較高;期望雜合度介于0.7518(HJ)~0.7845(WZ)之間,平均值為0.7704;觀測(cè)雜合度介于0.6880(JJ)~0.7879(HJ),平均值為0.7373;多態(tài)信息含量值介于0.66784(HJ)~0.72903(WZ),平均值為0.68095,屬高度多態(tài)。
(5)AMOVA分析結(jié)果表明,圓筒吻鮈的遺傳變異主要存在于種群內(nèi)部,只有少部分變異來源于種群間:遺傳分化指數(shù)Fst=0.03036(P=0.0
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