基于拓?fù)浜驼Z(yǔ)義相似性的疾病基因識(shí)別算法.pdf

1、疾病一直以來(lái)威脅著人類(lèi)的健康，雖然當(dāng)今社會(huì)擁有更先進(jìn)的醫(yī)療設(shè)備和診斷方法，但是，疾病問(wèn)題依然很?chē)?yán)峻。隨著人類(lèi)基因組全序列測(cè)序與工作草圖的完成，生命科學(xué)進(jìn)入了后基因組時(shí)代，生物科學(xué)技術(shù)得到迅猛發(fā)展，數(shù)據(jù)資源也快速增長(zhǎng)。因此，采用計(jì)算的方法從大量的生物數(shù)據(jù)中挖掘疾病和基因之間的關(guān)系得到了越來(lái)越廣泛的關(guān)注。
　　研究表明在蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)中有相互作用關(guān)系的編碼該蛋白質(zhì)的基因或者有相同功能的基因往往會(huì)導(dǎo)致相同的或者相似的疾病，據(jù)此提出了

2、很多基于蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的疾病基因識(shí)別方法。但是，通過(guò)分析，一些導(dǎo)致相同疾病的基因在網(wǎng)絡(luò)中表現(xiàn)出較弱的相互作用關(guān)系，從而影響疾病基因的識(shí)別工作。因此，本文提出了整合蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相似性和基因之間的語(yǔ)義相似性的方法來(lái)提高疾病基因識(shí)別的準(zhǔn)確性。首先計(jì)算蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)之間的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)相似性，并以所有編碼該網(wǎng)絡(luò)中蛋白質(zhì)的基因作為候選疾病基因，其次計(jì)算蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)中所有候選基因的基于生物學(xué)路徑的語(yǔ)義相似性，最后將這兩種相似性進(jìn)