水稻顯性矮稈基因LB4D的精細定位.pdf

1、株高是水稻品種株型改良的重要方面，目前水稻矮化育種利用的矮化基因很少，品種單一，這不利于水稻育種多樣性的發(fā)展。而大部分已定位的矮化基因都與不良性狀緊密連鎖，這限制了矮化基因的利用，因此鑒定新的矮稈基因，對水稻矮化育種和水稻品種創(chuàng)新尤為重要。
　　本研究發(fā)現(xiàn)的矮稈突變體LB4D來源于普通野生稻，具有稈矮多分蘗的特點。利用矮稈突變體LB4D與栽培稻品種（系）187R、廣恢998雜交產(chǎn)生的F2群體對顯性矮稈基因LB4D進行了精細定位。表

2、型觀察發(fā)現(xiàn)，LB4D基因?qū)λ局旮呔哂休^強的矮化作用，表現(xiàn)為顯性矮稈。通過顯微觀察，發(fā)現(xiàn)LB4D莖稈節(jié)間縮短是由莖稈縱向細胞數(shù)目減少造成的。在日本晴、廣恢998、187R等不同的遺傳背景條件下，LB4D基因造成水稻株高降低30％左右;利用水稻SSR標記引物，LB4D基因首先被定位在水稻第11號染色體上RM5704和RM202之間3.53Mb區(qū)域;為了進一步精細定位LB4D基因，參考水稻品種日本晴的基因組序列，在LB4D基因附近區(qū)域?qū)ふ也?/p>

3、入缺失序列，在RM5704和RM202之間發(fā)展了4個插入缺失標記，利用這4個標記將LB4D基因精細定位在indelA-7和indelg-15之間53.1 kb的區(qū)域。通過生物信息網(wǎng)站Gramene與Rice Genome，在基因定位區(qū)間找到了10個可能與水稻矮化相關(guān)的基因。并對其中可能的候選基因LOC_Os11g11000進行了初步的分析，發(fā)現(xiàn)其在2，3，11，13，號外顯子上發(fā)生了堿基替換，氨基酸比對后發(fā)現(xiàn)2號外顯子的突變造成了氨基酸