水稻半矮稈基因sdt3的精細(xì)定位和sdg的克隆與功能分析.pdf

1、揚(yáng)州大學(xué)博士學(xué)位論文水稻半矮稈基因sdt3的精細(xì)定位和sdg的克隆與功能分析姓名：隋炯明申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：博士專業(yè)：作物遺傳育種指導(dǎo)教師：顧銘洪李欣20060501揚(yáng)州大學(xué)博士學(xué)位論文和sdE突變體新桂矮中細(xì)胞的數(shù)目和伸長(zhǎng)情況，發(fā)現(xiàn)細(xì)胞伸長(zhǎng)的抑制是造成占匆矮化的原因，占瘩的野生型基因產(chǎn)物可能是一個(gè)調(diào)節(jié)細(xì)胞伸長(zhǎng)的因子。3、利用雙矮與02428雜交產(chǎn)生的F。群體對(duì)占出基因進(jìn)行了精細(xì)定位。s出基因首先被定位在水稻第5染色體上微衛(wèi)星標(biāo)記RM440和

2、SSR371之間，遺傳距離都是05cM。為了進(jìn)一步精細(xì)定位s電基因，我們擴(kuò)大了定位群體，并利用已經(jīng)公布的水稻基因組序列，在5出基因附近區(qū)域?qū)ふ椅⑿l(wèi)星序列并發(fā)展新的標(biāo)記，并在PM440和SSR37I之間找到了4個(gè)有多態(tài)的微衛(wèi)星標(biāo)記和3個(gè)CAPS標(biāo)記SSR5—51、CAP5—3、SSR5—7、CAP5—1、CAP5—2、SSR5—1和SSR5—17，分別與s由相距012cM、008cM004cM、OcM、OcM、006cM、042cM，其中

3、2個(gè)CAPS標(biāo)記CAP5一l和CAP5～2與s匆表現(xiàn)共分離，s出位于SSR5—7和SSR5—1之間。以此為基礎(chǔ)，構(gòu)建覆蓋sdg基因區(qū)域的BAC重疊群，s匆基因被定位在BAC克隆ACl05319約22kb的區(qū)段上，這為s出基因的圖位克隆奠定了基礎(chǔ)。4、根據(jù)s由基因定位區(qū)域的基因注釋信息以及相應(yīng)的序列測(cè)序和與日本晴數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)結(jié)果，我們將兩個(gè)預(yù)測(cè)基因作為占出的侯選基因。分別將這兩個(gè)來(lái)自日本晴BAC克隆的全長(zhǎng)基因?qū)雜dl／sdg突變體新桂矮

4、雙矮后，其中的一個(gè)基因能顯著增加sdZ／sdg雙矮突變體的株高，我們將這個(gè)基因定為5掰的候選基因。5、為了研究SDG基因的表達(dá)情況，構(gòu)建了SDG基因的啟動(dòng)子與GUS的嵌合基因。轉(zhuǎn)基因植株的GUS組織染色結(jié)果表明：5口占基因主要在根、莖、葉片等營(yíng)養(yǎng)器官表達(dá)，而且苗期的表達(dá)量高于抽穗后的表達(dá)量，而在生殖器官幾乎不表達(dá)。同時(shí)，我們又提取了不同器官的RNA，并進(jìn)行了RT—PCR檢測(cè)，表達(dá)情況與GUS組織染色結(jié)果相似。6、SDG基因共有2個(gè)外顯子