小麥全基因組抗赤霉病QTL關聯(lián)標記的篩選.pdf

1、赤霉病是小麥主要的流行病害之一。小麥赤霉病抗性是由多基因控制、存在主基因效應的數(shù)量遺傳性狀。與抗性相關的QTL在小麥21條染色體上均有分布。其中主效QTL主要分布在2A、3B、4A、4D、5A、5B、6A、6B和7A染色體上。當前小麥抗赤霉病分子育種工作困難重重，究其根本是小麥赤霉病表型鑒定準確性低，小麥的基因組復雜，全基因組測序尚未完成，不同的遺傳背景對QTL的效應也有影響，其中抗性相關QTL位點關聯(lián)標記不一致性等是主要問題。同時，在

2、小麥的21條染色體上與抗赤霉病QTL關聯(lián)的分子標記部分是多拷貝標記，不能明確其在染色體上的具體位置。我們認為定位目的基因和解析QTL效應應該以位點特異性的分子標記為主。本研究主要從單拷貝標記（即位點特異性標記）作為切入點，由于其只存在特定染色體位點上，因此可以大大提高抗赤效應解析的準確性。我們對近些年國內外發(fā)表的與赤霉病抗性相關的已知全基因組標記進行了篩選，得到了與赤霉病抗性相關的SSR標記386個，將這些標記進行電子PCR，通過序列分

3、析比對，統(tǒng)計出單拷貝標記，對于存在多個染色體位置的多拷貝標記，建議慎重使用，同時應在目標QTL區(qū)間內進一步開發(fā)一些新的與抗赤霉病關聯(lián)的位點特異性標記，有利于提高標記輔助選擇效率。
　　本研究在連續(xù)3季大田和3季溫室環(huán)境下評估了156個由推廣品種和地方品種組成的自然群體的赤霉病抗性，將386個SSR標記基因型與自然群體的表型進行關聯(lián)，分析了與已知QTL關聯(lián)的標記在自然群體中的重現(xiàn)情況、可能的等位變異及其對赤霉病表型的貢獻（即遺傳效應

4、）。共發(fā)現(xiàn)15個標記至少在兩季試驗中重復出現(xiàn)(P＜0.05），涉及2A、2D、3A、4A、4D、5A、5B、6A、6D、7A染色體。這些關聯(lián)標記中有9個為單拷貝標記，6個多拷貝標記，有9個標記位點存在有效等位變異。中國地方品種和日本品種攜帶更多的有利變異。有利等位變異數(shù)目越多的品種，赤霉病抗性越好。因此在今后的育種工作中建議增加具有鑒別性的單拷貝標記的使用，減少多拷貝標記的使用，引入有利變異的同時剔除不利等位變異，能夠使品種的赤霉病抗性