節(jié)桿菌HW08全基因組分析及其特性研究.pdf

1、苦馬豆素(swainsonine，SW)是瘋草的主要有毒成分，可以抑制α-甘露糖苷酶和甘露糖苷酶Ⅱ的活性，導(dǎo)致低聚糖貯積癥。動物攝入過量苦馬豆素后會表現(xiàn)出失重、精神抑郁、行為改變、不孕不育等臨床病理特征，目前仍缺乏有效的防治方法。微生物降解苦馬豆素可作為防治動物中毒的一種新思路。本實驗室分離出的節(jié)桿菌HW08(Arthrobacter sp.HW08)能高效降解苦馬豆素。為了揭示節(jié)桿菌HW08降解苦馬豆素的機(jī)制，探究節(jié)桿菌在惡劣環(huán)境中的

2、生存策略，本研究對節(jié)桿菌HW08進(jìn)行了全基因組測序、注釋和分析;并結(jié)合注釋結(jié)果對節(jié)桿菌HW08的底物利用多樣性、抗生素抗性和質(zhì)粒等進(jìn)行了研究，得到如下結(jié)果:
　　通過全基因組測序測序，發(fā)現(xiàn)節(jié)桿菌HW08含有一個大小為5，063，552 bp的環(huán)狀染色體，G+C含量為62.65％。通過基因注釋，共獲得4816個基因，其中4742個為蛋白編碼基因。通過與COG數(shù)據(jù)庫比對，發(fā)現(xiàn)節(jié)桿菌HW08的基因組中有將近半數(shù)的基因參與生物代謝。KEG

3、G代謝通路數(shù)據(jù)庫顯示這些基因分布于13個氨基酸代謝通路、14個糖代謝通路和11個脂質(zhì)代謝通路。GO數(shù)據(jù)庫注釋結(jié)果顯示，節(jié)桿菌HW08的基因可分為三個區(qū)域，區(qū)域1生物學(xué)途徑注釋到5943個基因;區(qū)域2細(xì)胞學(xué)組件中注釋到1752個基因。基因組分析還表明該菌有多個基因參與滲透壓調(diào)節(jié)和氧化應(yīng)激的保護(hù)，但在重金屬離子抗性方面僅注釋到了抗銅離子和砷酸鹽的相關(guān)基因。
　　底物利用多樣性試驗顯示該菌可以利用苯甲酸鈉、對氨基苯磺酸、4-氨基安替比林