大白菜霜霉病苗期抗性主效QTL--BraDM的精細定位.pdf

1、大白菜(Brassica rapa ssp.pekinensis)近年來逐漸成為世界性蔬菜作物。據農業(yè)部統(tǒng)計，我國大白菜每年種植面積約267萬公頃，占全國蔬菜總播種面積的15％左右，可見大白菜對我國蔬菜供應和農民增收具有重要作用。然而大白菜主產區(qū)霜霉病發(fā)病嚴重，發(fā)病面積日益擴大，因此大白菜霜霉病抗病品種的選育現已成為大白菜育種的主要目標之一。
　　遺傳圖譜在研究基因組結構以及對目的基因進行定位中，具有非常重要的作用。挖掘和分離不同

2、來源的抗性QTL，并通過分子設計育種進行高效聚合，選育穩(wěn)定、持久抗病品種，是保證大白菜安全無污染生產的有效途徑之一。本研究利用高感霜霉病大白菜自交系91-112和高抗霜霉病DH系T12-19，以及由二者為雙親構建的包含100個株系的DH群體為材料，通過構建高密度bin遺傳圖譜對大白菜霜霉病抗性進行QTL分析，主要研究結果如下:
　　1.利用3482個SLAF標簽和已公布的206個SSR和InDel標記組成了1064個bins，最終

3、構建了一個總長度為858.98 cM的高密度bin遺傳圖譜，利用該圖譜對不同發(fā)育時期的大白菜（溫室幼苗期、大田幼苗期、大田蓮座期和大田抽薹期）進行QTL分析，共檢測到6個與霜霉病抗性相關的QTL，其中4個QTL位于A08連鎖群上。
　　Yu等(2009)利用DH群體在A08連鎖群上定位了一個大白菜苗期霜霉病抗性主效QTL，即BraD，但該QTL的置信區(qū)間還較大，還需進一步精細定位研究。本研究在初級定位的基礎上，選擇了遺傳背景一致性

4、較高，而BraDM區(qū)域存在差異的兩個DH株系DH-60（高感霜霉?。┖虳H-88（高抗霜霉病），通過雜交、回交和游離小孢子培養(yǎng)構建了DH群體，包含232個株系，利用該群體對BraDM進行精細定位研究。主要結果如下:
　　2.根據父母本基因組重測序結果，開發(fā)出11對有效Indel標記，在DH232群體中作圖分析，結果發(fā)現BraDM被定位在Bra17865446與bru1209之間2.6 cM的區(qū)域，物理距離為340.085kb，與抗

5、病相關的候選基因有11個。
　　為進一步研究與大白菜苗期霜霉病抗性相關的位點，本研究組還利用960個SLAF分子標記與202份大白菜自然群體進行全基因組關聯分析，主要結果如下:
　　3.在A01染色體上檢測到1個新的與抗霜霉病關聯的SLAF標記，即SLAFMarkerA0124655323，根據該標記左右兩翼最近標記之間的距離確定熱點區(qū)間24573724～24755150的物理范圍。
　　4.利用該區(qū)間內的一個SNP位