藥物發(fā)現(xiàn)及靶向虛擬篩選的算法與程序設(shè)計.pdf

1、作者首先對目前藥物發(fā)現(xiàn)虛擬篩選中現(xiàn)存的方法進行了簡單的介紹及評述，指出了目前現(xiàn)有方法的不足及缺陷。作者在深入研究分子對接理論的基礎(chǔ)上，完成了三個藥物發(fā)現(xiàn)虛擬篩選的程序的開發(fā)與設(shè)計，并做了大量算例進行了測試驗證，其中的兩個程序已在國內(nèi)一些科研單位及高校得到了初步應(yīng)用?！　?作者建立基于信息熵的分子對接優(yōu)化模型，發(fā)展了多種群遺傳算法分子對接程序GAsDock，并對GAsDock的對接精度、篩選效率及對接速度進行了測試及驗證；與其它分子對接

2、軟件相比，GAsDock在對接精度上優(yōu)于現(xiàn)存的一些分子對接程序；另外，GAsDock在篩選效率方面較其他軟件有了明顯提高；GAsDock的計算時間與配體可旋轉(zhuǎn)鍵數(shù)目近似呈線性比例關(guān)系，能在保證精度的同時，更快地進行大規(guī)模數(shù)據(jù)庫的搜索?！　∽髡邚姆聪蚪嵌人伎寄壳暗姆肿訉蛹疤摂M篩選，提出了一種新的藥物及靶標(biāo)的發(fā)現(xiàn)的方法。建立了含有309個藥物靶標(biāo)的藥物分子靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫MDTD及182個HIV相關(guān)數(shù)據(jù)庫HTD，并對MDTD及HTD進行了系統(tǒng)