擬南芥及水稻中miRNA基因家族的擴(kuò)增方式及表達(dá)特征研究.pdf

1、本文對(duì)目前己知的擬南芥和水稻中的miRNA進(jìn)行分析表明，接近50％的miRNA是由基因組中的多個(gè)位置編碼產(chǎn)生的。利用生物信息學(xué)方法我們分析了擬南芥及水稻中多拷貝的miRNA基因家族成員可能的擴(kuò)增途徑，發(fā)現(xiàn)擬南芥中37％的miRNA基因和水稻中35％的miRNA基因之間存在基因復(fù)制的現(xiàn)象，我們認(rèn)為miRNA基因家族與許多編碼蛋白的基因家族，如轉(zhuǎn)錄因子基因家族成員的擴(kuò)增方式相似，兩者均利用了染色體中大片斷復(fù)制的方式使得家族中的成員數(shù)量得以擴(kuò)

2、增。為了分析這些miRNA基因家族中各基因的表達(dá)情況，我們利用RT-PCR的方法研究了水稻和擬南芥中共10個(gè)miRNA基因家族中的48個(gè)miRNA基因家族各個(gè)成員的表達(dá)情況，發(fā)現(xiàn)同一基因家族中的不同成員表達(dá)模式存在著差異，說(shuō)明在進(jìn)化過(guò)程中，這些不同成員的表達(dá)調(diào)控機(jī)制已經(jīng)出現(xiàn)了分化。此外，盡管miR160和miR162的序列在水稻和擬南芥中均比較保守，但這兩個(gè)基因家族的成員分別在水稻和擬南芥中表達(dá)特征卻并不相同，可能在水稻和擬南芥中對(duì)這兩

3、個(gè)基因家族的表達(dá)存在不同的調(diào)控機(jī)制。在對(duì)表達(dá)特征存在差異的擬南芥中miR168家族中的兩個(gè)基因At-MIR168a和At-MIR168b進(jìn)行功能分析時(shí)發(fā)現(xiàn)，這兩個(gè)基因均可以產(chǎn)生miR168，并調(diào)節(jié)其靶基因Agronaute1，說(shuō)明這兩個(gè)基因還未發(fā)生功能的分化而產(chǎn)生不同的miRNA。在對(duì)這兩個(gè)基因啟動(dòng)子活性分析時(shí)發(fā)現(xiàn)，轉(zhuǎn)錄水平的差異是造成這種表達(dá)模式差異的重要原因。對(duì)At-MIR168a啟動(dòng)子中可能在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中起作用的順式作用元件的初步分