亞麻抗白粉病基因的定位.pdf

1、亞麻（Linum usitatissmumL.）是亞麻科(Linaceae)亞麻屬(Linum)的一年生草本纖維植物。白粉病會(huì)危害亞麻的生長(zhǎng)，其發(fā)病的特點(diǎn)是，亞麻的植株表面會(huì)蒙上一層白粉狀的菌絲層，病原菌會(huì)侵染從地上至植株頂端的各個(gè)部分，病情傳播較為快速，帶來(lái)的后果為亞麻提前衰亡，產(chǎn)量降低，經(jīng)濟(jì)效益下降等。
　　本實(shí)驗(yàn)前期由黑龍江省農(nóng)業(yè)經(jīng)濟(jì)科學(xué)院楊學(xué)通過(guò)對(duì)田間抗病材料9801-1和感病材料Diane雜交、自交獲得的F1和F2代的田

2、間數(shù)據(jù)分析，證明F1代表現(xiàn)為完全抗病，F(xiàn)2代抗感分離比接近3∶1。證明抗病材料9801-1對(duì)白粉病抗性是完全顯性，是細(xì)胞核遺傳。
　　本實(shí)驗(yàn)是在此基礎(chǔ)之上，采用分子標(biāo)記技術(shù)，利用9801-1和Diane雜交自交獲得的高代回交群體BC3F6代，進(jìn)行亞麻抗白粉病基因的定位分析。試驗(yàn)所獲得的結(jié)果如下:
　　田間定期對(duì)亞麻的生長(zhǎng)狀況進(jìn)行觀察記錄，在亞麻白粉病發(fā)病期間獲得了亞麻白粉病孢子菌。在顯微鏡下觀察到白粉病孢子菌的形態(tài)，并且在田

3、間完成了接菌試驗(yàn)。
　　首先我選用SSR、AFLP、ISSR三種分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)亞麻抗白粉病基因進(jìn)行定位分析，經(jīng)過(guò)驗(yàn)證分析未找到很明確的與抗病基因緊密連鎖的標(biāo)記。
　　所以在此基礎(chǔ)上采取了對(duì)這兩個(gè)親本材料進(jìn)行全基因組測(cè)序。測(cè)序中以Lusitatissimum.m erge.fa作為參考基因組。為了便于分析，將測(cè)序序列連成假染色體，構(gòu)建了2個(gè)DNA文庫(kù)，共得到了18.07G的Clean data。通過(guò)比對(duì)測(cè)序結(jié)果，分析得到了存在

4、reads的最長(zhǎng)的11條染色體(Scaffold)的分布圖。同時(shí)對(duì)SNP、InDel、SV分布注釋情況進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。依據(jù)此數(shù)據(jù)，在有差異的位點(diǎn)處設(shè)計(jì)引物，試驗(yàn)共設(shè)計(jì)了121對(duì)InDel標(biāo)記，其覆蓋了11條染色體(Scaffold)。
　　通過(guò)對(duì)InDel標(biāo)記的篩選，成功的獲得了一個(gè)與抗病基因緊密連鎖的標(biāo)記，InDel標(biāo)記f2x4105，它位于ChrNew02(第2條)染色體上，scaffold145附近，實(shí)現(xiàn)了亞麻抗白粉病基因的初