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文檔簡介
1、腫瘤是影響人類健康的主要疾病之一,然而目前的腫瘤診斷方法和治療效果都不是很理想?;诨虮磉_譜的腫瘤分子診斷方法是一種全新的快速而準確的診斷方法,它還能檢測腫瘤的進展、惡化程度以及抗癌藥物的耐藥性等,為臨床醫(yī)生診斷腫瘤分型、提供治療方案以及分析預(yù)后提供一種重要參考。目前,具有“高維,小樣本”特征的微陣列數(shù)據(jù)不斷積累,如何有效地從這些高維數(shù)據(jù)中獲取有用信息或規(guī)律己成為當今信息科學與技術(shù)
從基因表達譜的成千上萬個基因中選擇分類
2、能力強,數(shù)量少的特征基因極具復(fù)雜性。通常情況下,在如此大的基因空間中進行窮盡搜索是不可能的。因此選擇合適的特征提取方法是非常重要的。
本論文中,我們在總結(jié)流形學習算法成果的基礎(chǔ)上,我們應(yīng)用一種新的特征提取方法和一些流形學習算法對兩類和多類分類問題進行了研究比較,最后我們利用CMVM(Constrained Maximum Variance Mapping,CMVM)和局部線性判別嵌入算法(locallylinear dis
3、criminant embedding,LLDE)算法對跨平臺腫瘤數(shù)據(jù)進行了分類比較研究。
本文主要作了以下研究工作:第一,把一種腫瘤基因表達數(shù)據(jù)特征提取方法——基于約束最大差異投影的特征提取方法(Constrained Maximum Variance Mapping:CMVM)應(yīng)用于腫瘤樣本基因特征提取,然后我們用K-NN分類器進行分類:在兩類分類實驗中,我們對前列腺癌數(shù)據(jù)集和乳腺癌數(shù)據(jù)集進行了特征提取及識別率的分析;
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