Markush結構分析與檢索系統(tǒng).pdf_第1頁
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文檔簡介

1、化學專利中普遍應用的Markush結構是由一個新穎的母體基團和可變取代基組成,由于可變取代基的復雜性使得Markush結構的檢索和匹配成為化學信息學領域的一個難題.本論文在深入研究了現(xiàn)有Markush結構處理方案和本課題組已有研究成果的基礎上,提出了一個處理Markush結構的兩階段方案.首先進行篩選,將Markush結構中相對穩(wěn)定的環(huán)和環(huán)之間的連接片斷提取出來構成族性結構的骨架(Scaffold),利用SMILES擴展算法程序對環(huán)和非

2、環(huán)原子,特別是對芳香環(huán)原子的識別算法,實現(xiàn)了結構式的程序分析,刪除環(huán)上的連接片斷,保留了環(huán)和環(huán)之間的連接片斷,利用程序自動生成了Markush結構的骨架.第二階段是在每一個骨架結構上添加非環(huán)的可變取代基,提取其中的官能團信息加以分析歸類,作為環(huán)的屬性描述.用面向對象程序設計方法(OOP)實現(xiàn)了骨架編碼方案的一系列算法,用Java語言完成了能夠運行于網(wǎng)頁的Applet程序StruDraw,對提問結構式能夠實現(xiàn)結構的分析,對于檢索用戶起向導

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