黑龍江省部分地區(qū)腎型傳支S基因的克隆與序列分析.pdf

1、本課題針對傳支病毒S基因的高變性，參考genebank已發(fā)表的IBV纖突蛋白基因序列，設計了三對引物，對雞傳染性支氣管炎病毒黑龍江腎型分離株MG/MK/K和澳大利亞標準株Υ株RNA進行RT-PCR擴增，并將擴增后得到的PCR產(chǎn)物克隆入pMD-18T克隆載體中進行序列測定和分析。結(jié)果顯示為IBVS基因。測序分析顯示，S基因的核苷酸全長為3498bp，編碼一條由1166個氨基酸組成的多肽，S1基因是IBV的高變區(qū)序列，S2基因相對比較保守，

2、3'端核苷酸相對于5'端保守，與網(wǎng)上報道的相一致。地方分離株MG株、MK株、K株分別和標準株T株比較，其同源性分別為89.2％、91.9％和91.4％。而MG和MK株的同源性為96.4％，MG和K株的同源性為95.7％，MK和K株的同源性為99.3％。地方分離株的親緣關系較近，而和T株的親緣關系較遠。MK和K株還可能是由同一株病毒變異而來，或者是同一株病毒在傳代的過程中發(fā)生了點突變造成的。S基因的克隆與測序添補了國內(nèi)在IBV序列數(shù)據(jù)上的