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文檔簡介
1、紫花苜蓿(Medicago sativa L.)是重要的牧草植物,開展紫花苜蓿的耐鹽特性的生理生化分析和轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究對其栽培和育種具有重要意義。本研究以12份紫花苜蓿品種為材料,比較了在鹽脅迫條件下不同品種的農(nóng)藝性狀變化;測定了4個苜蓿品種對鹽脅迫的生理反應(yīng)和變化;分析了‘中苜1號’品種在鹽脅迫不同時期的轉(zhuǎn)錄組和表達譜差異。研究為紫花苜蓿耐鹽種質(zhì)篩選和耐鹽特性研究提供了基礎(chǔ)。具體研究結(jié)果如下:
1,測定了在0,50,100,1
2、50和200 mmol/L NaCl濃度鹽脅迫下,供試品種的發(fā)芽率、發(fā)芽勢、株高、根長、鮮重等農(nóng)藝指標,采用隸屬函數(shù)法,綜合各項指標求得各品種的平均隸屬度值,據(jù)此評價各品種的耐鹽能力由強到弱排序為:‘印第安苜?!?,‘印第安2號’,‘金皇后’,‘Rambler’,‘WL252’,‘皇冠’,‘中苜1號’,‘秘魯苜蓿’,‘阿爾岡金’,‘敖漢苜?!埬?01’,‘三得利’。
2,測定了在0,50,100和150 mmol/L Na
3、Cl濃度鹽脅迫下,4個紫花苜蓿品種‘印第安苜?!熊?號‘,‘三得利’和‘敖漢苜?!谋Wo酶活性、滲透調(diào)節(jié)物質(zhì)含量、離子含量、光合效率等生理生化指標,經(jīng)主成份分析后得到丙二醛和保護酶系統(tǒng)對紫花苜蓿耐鹽能力影響較大生理生化指標。
3,利用Illumina測序技術(shù),對150 mmol/L NaCl濃度鹽脅迫下,0h、2h、4h和8h時間點的‘中苜1號’轉(zhuǎn)錄組進行測定。共獲得100.61M條的reads,總堿基數(shù)為20.32 G
4、。通過Trinity組裝共獲得長度大于200bp的Unigenes72,224條,Unigene的總長度約為49.5Mb,平均長度為685bp,N50長度為1084;將獲得Unigene,通過BLAST軟件與NR、SwissProt、TrEMBL、GO、COG、KEGG、Nt數(shù)據(jù)庫比對,最終獲得注釋信息的Unigenes有59,184個。對鹽脅迫0h、2h、4h和8h時間點的基因差異表達情況進行了分析,鹽脅迫0h與鹽脅迫2h相比,共有6
5、21個基因發(fā)生差異表達;鹽脅迫2h和鹽脅迫4h相比,共有4735條基因發(fā)生差異表達;鹽脅迫4h與鹽脅迫8h相比,共有5519條基因發(fā)生差異表達。
4,將差異基因與GO數(shù)據(jù)庫和KEGG數(shù)據(jù)庫比對注釋,經(jīng)顯著性富集后發(fā)現(xiàn),在鹽脅迫2h后,涉及植物信號轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)、膜的完整性等一些調(diào)節(jié)因子的基因被富集;在鹽脅迫4h后,植物有大量基因開始表達,其中能量代謝過程氧化磷酸化被顯著性富集,經(jīng)基因差異表分析,植物會有效的降低H+通過過氧化氫還原酶
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