水稻淀粉合成相關(guān)基因的優(yōu)異等位變異及食味品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、水稻是我國第一大糧食作物，提高產(chǎn)量和改良品質(zhì)是水稻育種的主要目標。已有研究表明，目前多數(shù)水稻品種遺傳基礎(chǔ)較窄，缺乏遺傳多樣性。揭示水稻栽培品種的遺傳多樣性，可以更充分了解國內(nèi)外水稻品種的遺傳背景，有助于配置雜交組合時合理選擇親本。水稻種質(zhì)材料中含有大量與食味品質(zhì)性狀相關(guān)的基因位點及等位變異，利用關(guān)聯(lián)分析方法挖掘與食味品質(zhì)性狀緊密關(guān)聯(lián)的位點，對水稻品質(zhì)改良具有重要意義。本研究以來源于我國各地方及國外的88份秈稻和184份粳稻品種為材料，利

2、用18個淀粉合成相關(guān)基因位點的功能標記和164個SSR標記對其進行遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析，并對其食味品質(zhì)性狀進行關(guān)聯(lián)分析，主要結(jié)果如下:
　　1.測定了88個秈稻品種的直鏈淀粉含量(AC)、糊化溫度(GT)、膠稠度(GC)、稻米淀粉粘滯性(RVA譜)特征值等11個食味品質(zhì)性狀以及184個粳稻品種的食味值、AC、GT、GC、RVA譜特征值等12個性狀，結(jié)果表明供試的88份秈稻和184份粳稻品種間各性狀差異較大，具有較豐富的多樣性。

3、
　　2.篩選得到18個淀粉合成相關(guān)基因位點的功能標記和164個SSR標記，分別對供試的秈、粳稻群體進行遺傳多樣性分析，秈稻中共檢測到727個等位變異，等位基因變幅為2～9，平均等位變異數(shù)為3.67，基因多樣性指數(shù)變幅為0.044～0.818，平均為0.446，多態(tài)信息含量(PIC)變幅為0.043～0.793，平均為0.400;粳稻中共檢測到628個等位變異，等位變異變幅為2～6，平均等位變異數(shù)為3.17，基因多樣性指數(shù)變幅為0

4、.0108～0.7658，平均為0.273，多態(tài)信息含量(PIC)變幅為0.0108～0.7267，平均為0.244。
　　3.利用PowerMark3.2和Structure2.3軟件分別對88份秈稻和184份粳稻進行聚類分析和群體結(jié)構(gòu)分析。根據(jù)遺傳相似性將88份秈稻聚類成四大類，根據(jù)親緣關(guān)系將88份秈稻分為3個類群，聚類分析和群體結(jié)構(gòu)分析的部分結(jié)果吻合。緬甸的X023、X027，孟加拉國品種的DHALA、DV1、SHADA，柬

5、埔寨的41580、41583、41586、41594以及福建的鴨腳術(shù)等秈稻品種可作為秈稻親本，配置雜交組合，豐富國內(nèi)秈稻種質(zhì)資源的遺傳多樣性。粳稻中參試的184份國內(nèi)外品種，國內(nèi)粳稻品種間以及國內(nèi)粳稻與日本粳稻品種間遺傳相似性均較高，遺傳基礎(chǔ)狹窄，所以在國內(nèi)粳稻育種中應(yīng)該大力引進新的種質(zhì)資源作為粳稻雜交親本，擴大雙親的遺傳基礎(chǔ)，以促使在雜交后代中出現(xiàn)豐富多樣的重組類型。
　　4.通過與食味品質(zhì)性狀的關(guān)聯(lián)分析，在秈稻品種中得到51個

6、關(guān)聯(lián)位點，在粳稻品種中得到30個關(guān)聯(lián)位點。粳稻和秈稻中定位的關(guān)聯(lián)位點差異較大，在秈稻中Wx基因附近定位到與GT、GC、CPV、PKV、SBV、CSV、BDV、PET等10個與食味品質(zhì)性狀關(guān)聯(lián)的位點;SSII-3基因附近定位到與GC、PKV兩個性狀關(guān)聯(lián)的3個位點。在粳稻中Wx基因附近只定位到與BDV、AC、PET相關(guān)聯(lián)的4個位點;在SSII-3基因附近定位到與GT(ASV)相關(guān)聯(lián)的1個位點;3號染色體中部的標記區(qū)間同時檢測到多個食味品質(zhì)性