基于SSR標(biāo)記的金針菇若干重要性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、金針菇作為我國(guó)主要的食用菌栽培品種之一，也是我國(guó)工廠化生產(chǎn)發(fā)展最快的栽培食用菌，產(chǎn)量居于世界上第四位，具有重要的商業(yè)價(jià)值。金針菇分布廣泛，種質(zhì)資源豐富，給金針菇遺傳育種提供了豐富的親本材料。金針菇的原基期、單瓶產(chǎn)量等農(nóng)藝性狀是具有連續(xù)變異特性的數(shù)量性狀，遺傳機(jī)制復(fù)雜，也是金針菇育種工作中的重要目標(biāo)性狀。分子標(biāo)記能直觀反映基因型特點(diǎn)，通過(guò)分子標(biāo)記與農(nóng)藝性狀關(guān)聯(lián)定位改良性狀已成功運(yùn)用在很多物種上，但金針菇的關(guān)聯(lián)定位工作仍處于起步階段。利用分

2、子標(biāo)記技術(shù)結(jié)合數(shù)量性狀的數(shù)據(jù)，以連鎖不平衡為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)分析方法進(jìn)行金針菇數(shù)量性狀的遺傳研究，給金針菇選育優(yōu)良新品種提供了新的思路。
　　本研究選擇保藏于上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院食用菌所的源自不同國(guó)家和地區(qū)的90個(gè)金針菇菌株為研究材料，通過(guò)液體培養(yǎng)菌種，工廠化條件下進(jìn)行栽培試驗(yàn)，探究了金針菇的原基期、菌柄長(zhǎng)度、菌柄直徑、菌蓋直徑、單瓶產(chǎn)量之間的相關(guān)程度。在依據(jù)金針菇Dan3測(cè)序結(jié)果設(shè)計(jì)合成的SSR引物中篩選到95個(gè)具有多態(tài)性的標(biāo)記，對(duì)材料的

3、遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分析。結(jié)合上述各個(gè)性狀的表型數(shù)據(jù)，通過(guò)基于連鎖不平衡的關(guān)聯(lián)分析方法，進(jìn)行了性狀與標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析研究，旨在發(fā)掘與農(nóng)藝性狀相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)。主要結(jié)果如下：
　　1.金針菇的原基期、菌柄長(zhǎng)度、菌柄直徑、菌蓋直徑、單瓶產(chǎn)量相關(guān)分析結(jié)果表明：?jiǎn)纹慨a(chǎn)量的變異最大，原基期的變異最小。菌柄長(zhǎng)度與原基期、單瓶產(chǎn)量成極顯著正相關(guān)，與菌蓋直徑顯著相關(guān)；而菌柄直徑與菌蓋直徑成極顯著相關(guān)。即金針菇各個(gè)性狀之間的相關(guān)性較小，部分性狀并不

4、相關(guān)。
　　2. SSR標(biāo)記等位變異豐富，95個(gè)SSR引物在供試菌株中共檢測(cè)到582個(gè)等位變異，單位點(diǎn)等位變異變化范圍為3～13個(gè)，平均為6.13個(gè)。各位點(diǎn)多態(tài)信息（PIC）含量變化范圍為0.204～0.818，平均為0.542；SSR遺傳相似系數(shù)介于0.605～0.995，平均為0.785。本研究供試的90個(gè)金針菇菌株來(lái)源廣泛，地理差異大，菌株間具有豐富的遺傳多樣性?；赨PGMA的聚類分析將90株金針菇分為4大類群，群體結(jié)構(gòu)分

5、析將供試菌株劃分為8個(gè)亞群，但兩者劃分結(jié)果具有很高的一致性。
　　3.95個(gè)SSR標(biāo)記位點(diǎn)產(chǎn)生的4465個(gè)組合位點(diǎn)的連鎖不平衡分布結(jié)果表明：在共線性和非共線性的SSR位點(diǎn)間都存在一定程度的LD。統(tǒng)計(jì)概率（p<0.01）支持的不平衡成對(duì)位點(diǎn)總位點(diǎn)組合數(shù)的78.72％，其中統(tǒng)計(jì)測(cè)驗(yàn)概率為0.001顯著水平的不平衡成對(duì)位點(diǎn)占總位點(diǎn)組合數(shù)的72.92%；連鎖不平衡程度D'>0.5的組合數(shù)占總位點(diǎn)組合數(shù)的33.01%。
　　4.通過(guò)T

6、ASEEL軟件中一般線性模型對(duì)個(gè)5個(gè)農(nóng)藝形狀與95個(gè)SSR分子標(biāo)記關(guān)聯(lián)分析結(jié)果表明：共檢測(cè)到7個(gè)與3個(gè)性狀顯著關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)，其中與菌柄直徑顯著相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有4個(gè)，分別為119、122、171、186，其表型變異解釋率依次為23.02%、21.86%、16.47%、22.02%；與單瓶產(chǎn)量顯著相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有2個(gè)，分別為99、171，其表型變異解釋率依次為18.94%、18.14%；與菌柄長(zhǎng)度顯著相關(guān)聯(lián)的位點(diǎn)有2個(gè)，分別為65、195，其表型