金針菇重要農(nóng)藝性狀與SSR分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、金針菇（Flammulina velutipes）是世界上著名的食藥用真菌之一，具有較高的營養(yǎng)價(jià)值和藥用價(jià)值。金針菇是我國工廠化生產(chǎn)程度較高的食用菌，也是工廠化生產(chǎn)規(guī)模和產(chǎn)量最高的食用菌種類。但我國金針菇生產(chǎn)用種品種單一，且多為國外引種的品種。金針菇種質(zhì)資源豐富，利用現(xiàn)有種質(zhì)資源選育具有我國自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的優(yōu)良菌株，是當(dāng)前金針菇育種工作面臨的重要而急迫的任務(wù)。金針菇重要農(nóng)藝性狀多為數(shù)量性狀，通過常規(guī)育種方法進(jìn)行改良，不僅耗時(shí)長，且不易得到

2、穩(wěn)定的表型。目前金針菇數(shù)量性狀定位（QTL）工作仍處在初級(jí)階段，運(yùn)用連鎖不平衡為基礎(chǔ)的關(guān)聯(lián)分析方法，為應(yīng)用分子標(biāo)記進(jìn)行金針菇農(nóng)藝性狀遺傳改良提供了新的思路。
　　本課題以金針菇39個(gè)菌株（8個(gè)野生菌株和31個(gè)栽培菌株）為試驗(yàn)材料，對(duì)供試菌株農(nóng)藝性狀進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，利用SSR標(biāo)記進(jìn)行了群體基因型分型，對(duì)供試群體進(jìn)行遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析；并開展了11個(gè)農(nóng)藝性狀與簡單序列重復(fù)（SSR）標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析。
　　1.采用多態(tài)性SSR分

3、子標(biāo)記對(duì)39個(gè)菌株進(jìn)行了遺傳多樣性和群體結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明，54對(duì)SSR引物共擴(kuò)增出220條帶，每對(duì)引物平均檢測(cè)到差異片段4.07個(gè)，單個(gè)引物檢測(cè)到差異片段變幅為2-8個(gè)。標(biāo)記的基因多樣性H、shannon信息指數(shù)I以及多態(tài)性信息含量PIC，平均值分別為0.42、0.79和0.38，表明供試群體具有較高的遺傳多樣性。依據(jù)群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果，供試群體分為Q1和Q2兩個(gè)亞群，兩個(gè)亞群間單瓶產(chǎn)量、菌柄長度、菌蓋直徑/菌柄長度呈極顯著差異，菌柄直

4、徑/菌柄長度呈顯著差異，Q2的遺傳多樣性參數(shù)極顯著高于Q1。
　　2.連鎖不平衡分析結(jié)果表明，54個(gè)SSR標(biāo)記位點(diǎn)組成的1431個(gè)位點(diǎn)組合中，基于r2統(tǒng)計(jì)概率P＜0.05支持的不平衡成對(duì)位點(diǎn)數(shù)目為665個(gè)，占總位點(diǎn)組合數(shù)的58.28％；統(tǒng)計(jì)概率P＜0.01支持的不平衡成對(duì)位點(diǎn)數(shù)目為472個(gè)，占總位點(diǎn)組合數(shù)的41.37%。在顯著連鎖不平衡組合中，65.56%的位點(diǎn)組合r2<0.1，25.11%的位點(diǎn)組合的r2處于0.1~0.2之間，

5、表明群體連鎖不平衡水平較低，且染色體內(nèi)部、染色體間的LD水平相當(dāng)，無顯著差異。
　　3.采用Tassel2.1軟件中的一般線性模型（GLM）對(duì)SSR標(biāo)記位點(diǎn)與11個(gè)農(nóng)藝性狀進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析，共檢測(cè)到6個(gè)SSR標(biāo)記與4個(gè)性狀顯著關(guān)聯(lián)。FV-C2-12和FV-C10-51兩個(gè)標(biāo)記與單瓶產(chǎn)量顯著關(guān)聯(lián)，表型變異解釋率分別為14.28%和20.45%；標(biāo)記 FV-C7-57與出菇期極顯著關(guān)聯(lián)，表型變異解釋率為46.97%；有兩個(gè)標(biāo)記（FV-C4