四個群體泥鰍的遺傳多樣性研究.pdf

1、采用線粒體控制區(qū)（Dloop）、線粒體細胞色素氧化酶亞基I（COI）和內(nèi)部簡單重復序列（ISSR）分析方法，對安徽懷遠（HY）、河南范縣（FX）、安徽舒城（SC）、安徽池州（CZ）4個群體泥鰍（Misgurnus anguillicaudatus）的遺傳多樣性、不同群體間遺傳分化及親緣關系進行研究，為品種的選育等提供理論依據(jù)。主要結(jié)果如下：
　　 1．對4個群體泥鰍的線粒體Dloop基因全序列進行測定和分析，經(jīng)過比對獲得9189

2、20bp核苷酸片段。識別了泥鰍mtDNA控制區(qū)的終止序列區(qū)（ETAS）、中央保守區(qū)（CD）和保守序列區(qū)（CSB）3個區(qū)域，指出一系列保守序列（CSBF、CSBE、CSBD和 CSB1、CSB2、CSB3）。
　　 序列中堿基T、C、A和G的平均含量分別為31.7％、19.9％、34.2％和14.3％，AT含量明顯高于GC含量。4個群體泥鰍中共發(fā)現(xiàn)71個變異位點，定義了36種單倍型。其中池州群體的核苷酸多樣性Pi、平均核苷酸差異數(shù)

3、K和群體內(nèi)遺傳距離均最大，表明池州群體遺傳多樣性最豐富，而舒城群體最小。MEGA 4.0軟件計算4個群體間的Kimura 2paramter遺傳距離，池州群體和舒城群體之間的遺傳距離最大，為0.01385，而懷遠群體和范縣群體間的遺傳距離最小，為0.00856。AMOVA分析表明，4群體間總的遺傳分化系數(shù)Fst=0.3148（P>0.05），群體內(nèi)分化為主要遺傳分化。NJ和UPGMA系統(tǒng)樹均表明4個群體聚為兩大類，池州群體聚為一類，懷遠

4、、范縣、舒城群體聚為另一類。Tajima′s D與 Fu′s值中性檢驗表明4個群體泥鰍過去并沒有群體擴張和持續(xù)增長模式，群體大小保持穩(wěn)定的狀態(tài)。
　　 2．對線粒體COI基因片段進行擴增測序，獲得597bp的核苷酸片段，其中變異位點138個，定義30種單倍型，未觀察到插入或缺失，堿基組成出現(xiàn)明顯偏倚性，轉(zhuǎn)換與顛換比為2.65，COI基因序列替換未達到飽和。池州群體具有最大的單倍型多樣度、核苷酸多樣性、平均核苷酸差異數(shù)和群體內(nèi)遺傳

5、距離，同時池州群體與其他群體間的遺傳距離、平均每位點核苷酸替代數(shù)（Dxy）和每位點凈核苷酸替代數(shù)（Da）
　　 均為最大，綜上，池州群體遺傳變異最高，遺傳多樣性最豐富。群體間遺傳分化系數(shù)Fst表明，池州群體與其他群體之間的遺傳分化達到高度分化水平。NJ和UPGMA聚類樹表明，懷遠與舒城群體最先聚為一支后于范縣群體相聚，最后與池州聚類，懷遠、范縣和舒城群體之間距離較近，池州群體與其他3個群體間的遺傳距離較遠。
　　 3．利

6、用ISSR分子標記技術研究4個群體的遺傳多樣性和群體間的差異。篩選出的15個引物擴增得到102條帶，多態(tài)性條帶比例為32.35％。綜合各群體所有遺傳多樣性指標看出，各群體遺傳多樣性水平為：池州>懷遠>范縣>舒城群體。4個群體間遺傳距離在0.040220.08532之間，其中池州群體與其他3個群體間的遺傳距離在0.079880.08532之間，數(shù)據(jù)顯示池州群體和其他群體間的遺傳距離最大。群體間總遺傳分化系數(shù)（Gst）為0.364，63.6