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文檔簡介
1、目的:番茄可溶性固形物是一個復雜且重要的數(shù)量性狀,屬核遺傳,受胞質(zhì)影響不大,以加性效應為主。利用SSR標記構建番茄遺傳連鎖圖譜,并對番茄可溶性固形物及相關品質(zhì)性狀進行初步動態(tài)QTL定位。為我國番茄品種的標記輔助選擇育種和優(yōu)質(zhì)性狀基因的圖位克隆提供一定的理論依據(jù)。
方法:本研究以加工番茄TD22和鮮食番茄HT-1-1-1-1雜交通過單粒傳自交獲得的166個F2單株組成的群體為材料,利用分子標記SSR(簡單重復序列,simpl
2、e sequence repeats)研究數(shù)量性狀基因座位??扇苄怨绦挝锸且粋€動態(tài)表達的過程,為了完全弄清QTL的遺傳作用,我們不僅應該知道它們在給定時間點的遺傳作用,而且還要了解它們的動態(tài)表達。用動態(tài)模型的分析方法分析可溶性固形物的表型值隨時間變化的函數(shù)模型,來檢測影響動態(tài)性狀變化過程的主基因。本研究在番茄果實發(fā)育的3個時期(綠熟期、黃熟期和紅熟期)進行動態(tài)QTL定位。
結果:
1.通過對TD22和HT-1
3、-1-1-1的F2:3家系品質(zhì)性狀的分析表明,各品質(zhì)性狀指標均符合正態(tài)分布,都是由微效多基因控制,呈現(xiàn)數(shù)量性狀的遺傳特點。品質(zhì)性狀間存在相關性,可溶性固形物在綠熟期與可溶性糖呈顯著正相關,與果重呈顯著負相關;黃熟期與可溶性糖和有機酸呈顯著正相關;紅熟期與可溶性糖和有機酸呈顯著正相關,與果重呈顯著負相關。經(jīng)過逐步線性回歸分析,建立線性回歸模型得到綠熟期回歸方程:Y=4.727-0.002 X1+1.089 X2;黃熟期回歸方程為:Y=4.
4、420+1.924X2+0.274X3;紅熟期回歸方程:Y=5.592-0.003 X1+0.9824 X2+0.294 X3。X1,X2,X3 分別代表單果重、可溶性糖和有機酸。
2.用500對番茄SSR標記對兩親本進行引物篩選,從中選出107對多態(tài)性和重復性好的SSR引物。對107個標記位點進行遺傳連鎖分析,初步構建了遺傳連鎖圖,其中包括5個連鎖群,88個標記,連鎖群長度范圍在19.082~118.178cM之間,標記
5、數(shù)目2~77之間,標記間的平均距離為2.33cM,最短距離為0.09cM,覆蓋214.36cM。
3.利用復合區(qū)間作圖法進行基因組QTL掃描,對09年番茄果實發(fā)育的(綠熟期、黃熟期和紅熟期)可溶性固形物及相關性狀進行QTL定位得到:三個時期分別檢測到關于SSC的4、0和8個QTL;檢測到關于果重的2、3和2 QTL;檢測到關于果形指數(shù)的1、0和0 QTL;檢測到關于可溶性糖的1、1和5個QTL;檢測到關于有機酸的0、1和1
6、 QTL;沒有檢測到關于VC的QTL。
結論:
1.各個時期SSC的顯著相關性狀有差異,可溶性糖是SSC的一個主要因子;
2.本研究中的連鎖群共有5個,連鎖群標記數(shù)在3個以下的2個。在同一連鎖群上,有些標記間的遺傳距離較遠,達30 cM以上,接近自由交換值。由此可見,標記在基因組上的分布較為松散,造成這種情況的原因可能是多方面的;
3.在綠熟期和紅熟期共同檢測關于可溶性固形物的LE
7、aat006和Tomato│TC162363這兩個標記,說明番茄果實發(fā)育的過程中一些跟番茄SSC相關的數(shù)量性狀基因一直在表達,黃熟期沒有檢測到QTL可能原因是標記覆蓋基因組較少,只有5個連鎖群,但有可能出現(xiàn)在其他連鎖群上。同時三個時期檢測到的QTL又呈現(xiàn)動態(tài)變化,說明數(shù)量性狀基因的表達受時空限制。Tomato│TC162363和LEaat006,其中LEaat006在綠熟期和紅熟期的貢獻率都達到10%以上,會給分子標記的輔助選擇育種提供
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