小麥4A染色體六個農(nóng)藝性狀的關(guān)聯(lián)分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、小麥是世界上最主要的糧食作物之一,不斷提高其單位面積產(chǎn)量一直是現(xiàn)代育種的主要目標。小麥產(chǎn)量及其相關(guān)性狀多數(shù)為數(shù)量性狀,研究這些數(shù)量性狀位點(QTL)可為分子標記輔助選擇和基因克隆奠定一定的基礎(chǔ),進而指導小麥良種的選育。關(guān)聯(lián)分析是一種以連鎖不平衡(LD)為基礎(chǔ),鑒定某一群體內(nèi)性狀與遺傳標記或候選基因關(guān)系的方法,已成為研究植物基因(QTL)的有效手段之一。
   本研究以103份冬性小麥種質(zhì)為材料,首先利用背景標記明確這些材料的遺傳

2、多樣性、群體結(jié)構(gòu)(Q)和系譜關(guān)系矩陣(K);然后通過檢測材料中4A染色體上Genomic-SSR標記的多態(tài)性,分析4A染色體的連鎖不平衡結(jié)構(gòu);同時對供試材料六個農(nóng)藝性狀進行重復的表型鑒定;最后在考慮Q和K的基礎(chǔ)上,進行4A染色體上標記多態(tài)性與六個農(nóng)藝性狀之間的關(guān)聯(lián)分析,鑒定出控制六個農(nóng)藝性狀的QTL。獲得的主要結(jié)果如下:
   1.本研究選用49個Genomic-SSR和40個EST-SSR標記位點對供試材料進行了遺傳多樣性和群

3、體結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明:89個位點共擴增出531個等位變異,平均每個位點5.97個;平均基因多樣性和多態(tài)性信息量(PIC)分別為0.63和0.57,說明供試材料遺傳多樣性比較豐富,可用于關(guān)聯(lián)分析;利用NJ法聚類和群體結(jié)構(gòu)分析均將供試材料劃分為六大類群,且聚類結(jié)果基本吻合;群體結(jié)構(gòu)分析還闡明了各材料的遺傳組成,推測66%的材料血緣相對比較單一,34%的材料擁有混合來源。
   2.利用小麥4A染色體上的31對Genomic-SSR引

4、物(標記平均間隔距離為2.4cM)對103份供試材料進行標記多態(tài)性分析。結(jié)果表明:31對引物共擴增出208個等位變異,平均6.7個:平均基因多樣性和PIC分別為0.59和0.55;確定了群體的背景LD值為r2=0.054,并計算出4A染色體上標記間LD衰減距離為~3cM,適合基于基因組掃描的關(guān)聯(lián)分析;同時在4A染色體長臂和著絲點附近發(fā)現(xiàn)了3個LD blocks。
   3.利用TASEELV2.01軟件中的混合線性模型進行標記與

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