雞常染色體矮小性狀的候選基因研究.pdf

1、為了探尋導(dǎo)致雞常染色體矮小性狀的主效基因，本實驗主要從以下幾個方面進行了研究： 1.根據(jù)前人的初步定位結(jié)果結(jié)合比較基因組學(xué)手段，在雞的1號染色體上確定一段長度為2.7Mb，包含52個基因的物種間同線性保守區(qū)域作為研究adw的候選區(qū)間。以荷蘭瓦大兩個常染色體矮小雞家系中正常體型個體與adw個體的DNA以及科尼什矮小公雞和白菜航矮小公雞的精子庫DNA為材料，對候選區(qū)間基因的功能區(qū)域進行測序比對，獲得39個與adw性狀有一定連鎖的SN

2、P標(biāo)記，包括來自4個不同基因的9個非同義突變。 2.運用PCR—RFLP技術(shù)，對上述4個候選基因中發(fā)現(xiàn)的功能SNP標(biāo)記與adw性狀的連鎖情況進行分析，結(jié)果顯示ASCL4基因外顯子1中的一個引起脯氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)榱涟彼幔≒—L）的C/T非同義突變僅存在于adw家系品種中。進一步運用PCR—RFLP技術(shù)對11個非相關(guān)的adw家系的所有個體檢測此位點基因型，結(jié)果表明純合的T等位基因型與adw性狀完全連鎖。 3.運用焦磷酸測序技術(shù)對包

3、括27個中國地方雞種、1個性連鎖矮小雞品種以及1個原因不明的國內(nèi)常染色體矮小雞品種在內(nèi)的870個個體檢測ASCL4基因外顯子1中發(fā)現(xiàn)的特異SNP位點。結(jié)果顯示，國內(nèi)各種體型雞均只有正常的C等位基因，而未檢測到該位點上與矮小性狀相連鎖的T突變等位基因，說明該SNP位點具有極強的特異性，為adw家系所特有。 4.實時定量PCR檢測ASCL4在正常白菜航雞的不同發(fā)育時期，不同組織中的表達情況。結(jié)果表明，胚胎期ASCL4主要在大腦、軀體