水稻重要穗部性狀QTLs的定位和克隆.pdf

1、揚州大學(xué)博士學(xué)位論文水稻重要穗部性狀QTLs的定位和克隆姓名：周勇申請學(xué)位級別：博士專業(yè)：植物生物技術(shù)指導(dǎo)教師：梁國華200905012一揚州大學(xué)博士學(xué)位論文對粒長有明顯的遺傳效應(yīng)，把Os09926999確定為qPE9『的候選基因。通過互補試驗、RNAi和過量表達(dá)試驗證明了Os09926999就是qPE9，J基因，而且來源于R6547和日本晴的等位基因qPE9』是功能基因，來源于武運粳8的功能缺失基因qpe9，J導(dǎo)致了直立穗表型；4、來

2、源于R6547的qPE9一』基因包含5個外顯子和4個內(nèi)含子，編碼一個426氨基酸的蛋白質(zhì)，該蛋白包含3個VonWillebrandFactorTypeC(vwFc)結(jié)構(gòu)域，1個跨膜結(jié)構(gòu)域，1個4disulfide—core結(jié)構(gòu)域。與R6547的等位基因進(jìn)行比較，發(fā)現(xiàn)武運粳8的等位基因存在17處變異，包括13個單核苷酸變異(SNPs)和4個插入缺失變異(InDels)，分別命名為SNPlSNPl3和InDell—InDel4。但SNPl一

3、SNPl2和InDellInDel3均位于內(nèi)含子內(nèi)，沒有造成二者在氨基酸水平上的差異。SNPl3和InDel4位于第5個外顯子內(nèi)，并且都造成氨基酸變異。SNPl3導(dǎo)致了一個氨基酸的替換，InDel4使武運粳8在第5外顯子缺失了637個核苷酸，并有12個核苷酸的插入，在突變位點后形成一個蛋白質(zhì)翻譯終止密碼子，造成武運粳8的等位基因編碼的蛋白缺失了C端231個氨基酸。通過序列分析和轉(zhuǎn)基因試驗證明InDel4造成了直立穗表型；5、qPE9一J

4、基因在莖和莖節(jié)中表達(dá)最高，在根中表達(dá)最弱，在葉和穗中也能檢測到表達(dá)；在近等基因系的相同組織中表達(dá)量沒有差異，基因組水平的變異沒有對表達(dá)水平造成影響。將qPE9—1一GFP融合蛋白在水稻原生質(zhì)體中瞬時表達(dá)顯示，qPE91蛋白是一個膜蛋白。二、水稻粒型主效QTLqGS71的鑒定和精細(xì)定位1、從132個以日本晴為供體和廣陸矮4為受體構(gòu)建的染色體片段代換系中鑒定了一個粒型與輪回親本有很大差異的株系C1044。該株系表現(xiàn)為粒型細(xì)長，而且兩年兩地的