多性狀聯(lián)合定位小鼠焦慮相關QTLs.pdf

1、發(fā)展用于定位復雜性狀基因有效的統(tǒng)計方法是一項很有挑戰(zhàn)性的工作。新的定位軟件OTLNetwork V2.2，是基于分子標記多態(tài)性定位數(shù)量性狀基因座(QTLs)，基于單核苷酸多態(tài)性定位數(shù)量性狀核苷酸(QTSs)和基于連續(xù)變異表達值定位數(shù)量性狀表達譜(QTTS)的三種定位策略開發(fā)的，用以檢測主效基因和上位性基因的位置，估計各種遺傳效應以及預測它們與環(huán)境互作效應。軟件還可研究多個數(shù)量性狀的基因定位問題。本論文以一組由C57BL/6J和DBA/2

2、J組合衍生的重組自交系數(shù)據(jù)來驗證以上新方法的可行性和有效性。本論文共分三章，主要內容概括如下：
　　 第一章為數(shù)量遺傳學QTL定位的背景和文獻綜述。
　　 第二章進行了BXD近交系小鼠的Marker、SNP和表達譜數(shù)據(jù)的定位分析。用506個微衛(wèi)星標記，QTL方法定位探測到8個QTLs，包括3個主效QTLs(h2=0.27)和3對上位性QTLs(h2=0.23)。用2320個SNP標記，QTS方法定位探測到17個QTSs，

3、包括7個主效QTSs(h2=0.25)和6對上位性QTSs(h2=0.22).表達譜數(shù)據(jù)采用小樣本群體(5種處理下的188個體)定位，只探測到1個主效QTT(h2=0.07)和2對效應微小的上位性QTTs。比較第1條和第11條染色體上三種方法的探測結果，發(fā)現(xiàn)3個主效QTSs正好落在3個QTLs的區(qū)間內，而QTTs的位置與第一條染色體上QTL位置相匹配。通過實例分析驗證了方法的可行性和有效性。
　　 第三章是多性狀聯(lián)合定位小鼠焦慮

4、相關QTLs。利用GeneNetwork公共平臺的BXD近交系小鼠數(shù)據(jù)，對小鼠71個品系的528個體的焦慮相關性狀用QTLNetwork v2.2軟件進行多性狀QTL定位分析。研究控制多性狀的數(shù)量性狀基因座(QTL)，分析主效和上位性QTL，以及主效和上位性與環(huán)境的互作。通過對小鼠數(shù)據(jù)的QTL定位分析和蒙特卡羅模擬，結果表明：如果性狀間存在較強的遺傳相關，多性狀聯(lián)合定位能提高統(tǒng)計功效和參數(shù)估計的精確性，也能有效鑒定基因的一因多效和基因的