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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
探究廣西北侖河口紅樹(shù)林植物根際土壤放線菌資源多樣性并進(jìn)行抗菌活性研究,為新抗生素發(fā)現(xiàn)提供藥用放線菌資源。
方法:
采用5種分離培養(yǎng)基,以稀釋涂布法分離放線菌;通過(guò)PCR擴(kuò)增獲得菌株16S rRNA基因并進(jìn)行同源性比對(duì),分析放線菌多樣性;發(fā)酵液經(jīng)乙酸乙酯萃取,菌絲經(jīng)丙酮浸泡,分別獲得發(fā)酵液水相、發(fā)酵液酯相和菌絲丙酮浸提液三類樣品;標(biāo)準(zhǔn)紙片擴(kuò)散法進(jìn)行抗菌活性的篩選;抗菌活性菌株應(yīng)用PCR擴(kuò)增對(duì)其進(jìn)行PK
2、S I、PKS II及NRPS生物合成基因的篩選。
結(jié)果:
來(lái)自廣西北侖河口紅樹(shù)林保護(hù)區(qū)的7份紅樹(shù)林植物根際土壤樣品,從中分離純化得到放線菌110株,歸屬于放線菌綱的7個(gè)目9個(gè)科15個(gè)屬,優(yōu)勢(shì)菌屬為小單孢菌屬和鏈霉菌屬;菌株N04M112、3804M13、Z05M23、Z07M34的16S rRNA基因序列與有效發(fā)表菌株 Agromyces humatus CD5T(AY618216)、Streptomyces at
3、rovirens NRRLB-16357T(DQ026672)、Streptosporangium jomthongense30EHST(JQ922513)、 Micromonospora wenchangensis2602GPT1-05T(JQ768361)的相似率最高,分別為97.49%、98.42%、98.58%、98.54%,可能為潛在新物種;抗菌活性檢測(cè)結(jié)果表明,51株放線菌中,46株有抗菌活性,總陽(yáng)性率為90.20%;對(duì)這4
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