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
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文檔簡介
1、生物信息學(xué)課后習(xí)題及答案生物信息學(xué)課后習(xí)題及答案(由10級生技一、二班課代表整理)一、緒論一、緒論1.你認(rèn)為,什么是生物信息學(xué)?采用信息科學(xué)技術(shù),借助數(shù)學(xué)、生物學(xué)的理論、方法,對各種生物信息(包括核酸、蛋白質(zhì)等)的收集、加工、儲(chǔ)存、分析、解釋的一門學(xué)科。2.你認(rèn)為生物信息學(xué)有什么用?對你的生活、研究有影響嗎?(1)主要用于:在基因組分析方面:生物序列相似性比較及其數(shù)據(jù)庫搜索、基因預(yù)測、基因組進(jìn)化和分子進(jìn)化、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測等在醫(yī)藥方面:新
2、藥物設(shè)計(jì)、基因芯片疾病快速診斷、流行病學(xué)研究:SARS、人類基因組計(jì)劃、基因組計(jì)劃:基因芯片。(2)指導(dǎo)研究和實(shí)驗(yàn)方案,減少操作性實(shí)驗(yàn)的量;驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)結(jié)果;為實(shí)驗(yàn)結(jié)果提供更多的支持?jǐn)?shù)據(jù)等材料。3.人類基因組計(jì)劃與生物信息學(xué)有什么關(guān)系?人類基因組計(jì)劃的實(shí)施,促進(jìn)了測序技術(shù)的迅猛發(fā)展,從而使實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)和可利用信息急劇增加,信息的管理和分析成為基因組計(jì)劃的一項(xiàng)重要的工作。而這些數(shù)據(jù)信息的管理、分析、解釋和使用促使了生物信息學(xué)的產(chǎn)生和迅速發(fā)展。4簡
3、述人類基因組研究計(jì)劃的歷程。通過國際合作,用15年時(shí)間(19902005)至少投入30億美元,構(gòu)建詳細(xì)的人類基因組遺傳圖和物理圖,確定人類DNA的全部核苷酸序列,定位約10萬基因,并對其他生物進(jìn)行類似研究。1990,人類基因組計(jì)劃正式啟動(dòng)。1996,完成人類基因組計(jì)劃的遺傳作圖,啟動(dòng)模式生物基因組計(jì)劃。1998完成人類基因組計(jì)劃的物理作圖,開始人類基因組的大規(guī)模測序。Celera公司加入,與公共領(lǐng)域競爭啟動(dòng)水稻基因組計(jì)劃。1999,第五
4、屆國際公共領(lǐng)域人類基因組測序會(huì)議,加快測序速度。2000,Celera公司宣布完成果蠅基因組測序,國際公共領(lǐng)域宣布完成第一個(gè)植物基因組——擬南芥全基因組的測序工作。2001,人類基因組“中國卷”的繪制工作宣告完成。2003,中、美、日、德、法、英等6國科學(xué)家宣布人類基因組序列圖繪制成功,人類基因組計(jì)劃的.目標(biāo)全部實(shí)現(xiàn)。2004,人類基因組完成圖公布。2.我國自主知識產(chǎn)權(quán)的主要基因組測序計(jì)劃有哪些?水稻(2002),家雞(2004),家蠶
5、(2007),家豬(2012),大熊貓(2010)二二第一章第一章2.TSS外顯子和內(nèi)含子的概念。TSS是轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)(TranionStartSite)的英文縮寫,是指DNA上一段與RNA聚合酶結(jié)合并起始轉(zhuǎn)錄的一段DNA序列。真核生物結(jié)構(gòu)基因,由若干個(gè)編碼區(qū)和非編碼區(qū)互相間隔開但又連續(xù)鑲嵌而成,去除非編碼區(qū)再連接后,可翻譯出由連續(xù)氨基酸組成的完整蛋白質(zhì),這些基因稱為斷裂基因。其中的編碼區(qū)即為外顯子,非編碼區(qū)即為內(nèi)含子。3.如何判斷起始
6、密碼子?內(nèi)含子?AUG甲硫氨酸(met)內(nèi)含子(5’GT……AG3’)4.蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)有哪些?(1)螺旋(2)b折疊–平行折疊反平行折疊(3)b轉(zhuǎn)角–連接作用”U”型結(jié)構(gòu)(大多PheGly組成)(4)無規(guī)卷曲沒有確定規(guī)律性的肽鏈構(gòu)象,但仍是緊密有序的穩(wěn)定結(jié)構(gòu)(5)無序結(jié)構(gòu)多肽鏈中有60%的區(qū)段為a螺旋和b折疊5、HGP選擇作為研究人類的四大“模式生物“有哪些?酵母、線蟲、果蠅、小鼠。6、背誦生物信息數(shù)據(jù)庫中的核苷酸代碼?52生物信息數(shù)
7、據(jù)庫中的核苷酸代碼NA或C或G或T(U)V非TSG或CH非GMA或CD非CRA或GB非AWA或T(U)TT(胸腺嘧啶)KG或T(U)GG(鳥嘌呤)YC或T(U)CC(胞嘧啶)UU(尿嘧啶)AA(腺嘌呤)代碼核苷酸代碼核苷酸NA或C或G或T(U)V非TSG或CH非GMA或CD非CRA或GB非AWA或T(U)TT(胸腺嘧啶)KG或T(U)GG(鳥嘌呤)YC或T(U)CC(胞嘧啶)UU(尿嘧啶)AA(腺嘌呤)代碼核苷酸代碼核苷酸生物信息數(shù)據(jù)庫
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