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文檔簡介
1、蛋白質注釋及功能分析蛋白質注釋及功能分析利用基因本體GO(geneontology)或者其它的功能注釋系統(tǒng)(工具)來分析蛋白質的功能。然后提供蛋白質功能注釋的統(tǒng)計分布情況。(如表1和圖1所示)該分析結果可以給出差異表達蛋白質總體的功能分布,從而使研究人員整體上把握疾病與分子功能之間的相關性。Table1ProteinfunctionaldistributioninXXXCategyBaitsignaltransduction93(30.
2、8%)celldifferentiation18(6.0%)apoptosis55(18.2%)cellganizationbiogenesis20(6.6%)cellproliferation30(9.9%)tranion75(24.8%)transpt47(15.6%)development56(18.5%)metabolism222(73.5%)biosynthesis42(13.9%)cytosol31(11.6%)endopl
3、asmicreticulum15(5.6%)cytoskeleton14(5.2%)nucleus132(49.3%)membrane68(25.4%)CategyBaitsignaltransduction93(30.8%)celldifferentiation18(6.0%)apoptosis55(18.2%)cellganizationbiogenesis20(6.6%)cellproliferation30(9.9%)trani
4、on75(24.8%)transpt47(15.6%)development56(18.5%)metabolism222(73.5%)biosynthesis42(13.9%)cytosol31(11.6%)endoplasmicreticulum15(5.6%)cytoskeleton14(5.2%)nucleus132(49.3%)membrane68(25.4%)CategyBaitsignaltransduction93(30.
5、8%)celldifferentiation18(6.0%)apoptosis55(18.2%)cellganizationbiogenesis20(6.6%)cellproliferation30(9.9%)tranion75(24.8%)transpt47(15.6%)development56(18.5%)metabolism222(73.5%)biosynthesis42(13.9%)cytosol31(11.6%)endopl
6、asmicreticulum15(5.6%)cytoskeleton14(5.2%)nucleus132(49.3%)membrane68(25.4%)#ofProtein1%1%1%3%7%2%1%1%2%4%3%3%1%2%11%9%20%2%2%3%1%21%reproductioncellkillingimmunesystemprocessmetabolicprocesscellularprocessviralreproduct
7、ionreproductiveprocessbiologicaladhesionmulticellularganismalprocessdevelopmentalprocessgrowthlocomotionpigmentationrhythmicprocess050100150200250300350400450reproductionimmunesystemprocesscellularprocessreproductiveproc
8、essmulticellularganisma...growthpigmentationpositiveregulationof...regulationofbiologica...localizationmultiganismprocessCategies#ofProteinFigure1ProteinfunctionaldistributioninXXXGOanalysisoftheidentifiedproteinsphospho
9、proteins.TheidentifiedriceproteinsricephosphoproteinsArabidopsisproteinsArabidopsisphosphoproteinsarerepresentedbyblueredgreenpurplebarsrespectively.ACellularlocalization.BMolecularfunction.CBiologicalprocess.(HirofumiNa
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