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1、好氧不產(chǎn)氧光合細(xì)菌(AAPB)作為地球上最古老的細(xì)菌類群,對(duì)于水體碳循環(huán)有著重要作用。目前,自然環(huán)境條件下研究所得出的碳源、鹽度對(duì)淡水AAPB群落結(jié)構(gòu)的影響及其變化規(guī)律不盡相同,而以人為分別改變碳源和鹽度來(lái)進(jìn)行單因素實(shí)驗(yàn)分析有望為理解水生生態(tài)系統(tǒng)AAPB群落結(jié)構(gòu)的控制機(jī)制提供依據(jù)。
烏梁素海是黃河流域最大的淡水湖泊,其中蘊(yùn)含有豐富的好氧不產(chǎn)氧光合細(xì)菌(AAPB)資源。因此,本文首先針對(duì)PCR-DGGE實(shí)驗(yàn)中出現(xiàn)的擴(kuò)增問(wèn)題,通過(guò)
2、比對(duì)篩選了最佳優(yōu)化劑組合。之后運(yùn)用PCR-DGGE,結(jié)合QPCR技術(shù)對(duì)經(jīng)碳源、鹽度誘導(dǎo)處理的烏梁素海水樣菌群進(jìn)行分析,結(jié)果表明:
(1)經(jīng)土壤、水樣DNA驗(yàn)證后篩選出了最適PCR優(yōu)化劑組合DBD-2(2%DMSO,0.8 M Betaine,2 mM DTT),發(fā)現(xiàn)同一樣品在應(yīng)用優(yōu)化劑后于DGGE圖譜上能夠檢測(cè)到更多條帶,并證實(shí)了該優(yōu)化劑組合對(duì)多種Taq酶的適用性,且對(duì)于弱條帶的重?cái)U(kuò)增同樣能夠起到優(yōu)化作用。
(2)對(duì)
3、烏梁素海水體人為添加3種碳源誘導(dǎo),經(jīng)分析后發(fā)現(xiàn)碳源能夠使得水體總細(xì)菌群落豐富度提升約45%,多樣性提升約10%;AAPB菌群豐富度提高36.3%,多樣性提升約4%。碳源誘導(dǎo)使得AAPB菌群中Alpha-及Gamma-proteobacteria的比例增加,丙酮酸鈉作為誘導(dǎo)效果最佳的碳源,能夠提升水體中部分AAPB功能菌的豐度。
(3)對(duì)烏梁素海水體進(jìn)行鹽度處理,發(fā)現(xiàn)碳源能夠使得水體總細(xì)菌群落豐富度提升約16.6%,多樣性則下降
4、約5%;AAPB菌群豐富度提高63.6%,多樣性提升約8%。CCA分析發(fā)現(xiàn)水體細(xì)菌及AAPB與TN、TP、Chl a、鹽度等顯著相關(guān)。細(xì)菌各類群比例在鹽處理后變化不大,但值得注意的是,在5%鹽度處理下, Gamma-proteobacteria類群比例顯著增加。QPCR結(jié)果顯示,1%鹽度處理14 d后,16S rRNA拷貝數(shù)相比同時(shí)期對(duì)照樣品提升了約7.8倍,5%鹽度處理樣品中pufM拷貝數(shù)提升約10倍,表明鹽環(huán)境可能更有利于烏梁素海水
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