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文檔簡介
1、蛋白質(zhì)的結構和性質(zhì)對溶液環(huán)境酸堿程度有著很強的依賴性。但與溶液中的自由氨基酸pKa不同,蛋白質(zhì)各殘基pKa與其周圍的環(huán)境密切相關。為了從結構變化獲得信息,分子模仿技術得到了廣泛應用。牛血清蛋白(BSA)是血漿中含量最豐富的蛋白,是含有唯一自由半胱氨酸的自然蛋白質(zhì)。因此,為了深入探討pH對蛋白質(zhì)Cys活性殘基的微區(qū)結構變化的影響,我們以牛血清蛋白為模型蛋白,通過熒光光譜方法對pH誘導蛋白質(zhì)微區(qū)結構及特性的變化情況進行測量,并結合應用分子模
2、擬的結果嘗試進行解釋。
通過SWISS-MODEL進行同源模建得到牛血清白蛋白結構的初始結構。應用PKa預測方法能夠得到蛋白質(zhì)側(cè)鏈的質(zhì)子化狀態(tài)。我們從BSA的唯一含巰基的半胱氨酸殘基兩側(cè)截取了共21個氨基酸殘基,并且對其進行結構優(yōu)化。本研究中,采用5-Maleimido-fluorescein diacetate對BSA的半胱氨酸殘基進行特異性標記,通過對熒光光譜和各向異性改變的分析,從而探討探針標記的特定位點的局部構象和
3、環(huán)境的變化。將模擬和實驗的數(shù)據(jù)相結合,分析溶液pH改變誘導的蛋白質(zhì)局部環(huán)境和構象的變化。
實驗表明,在BSA在不同pH值體系中,其熒光偏振值(FP)的大小會呈現(xiàn)出相應的變化。pH值為5時,F(xiàn)P最小。在強酸環(huán)境中,BSA的熒光偏振值隨溶液酸度增強而增大,氫離子的結合使BSA微區(qū)殘基帶上了多余的正電荷。而在較強堿性環(huán)境中,BSA分子充分伸展,熒光偏振值整體較酸性環(huán)境大。而在pH值為11時,F(xiàn)P值反而有所降低。
通
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