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    • 簡介:安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文黃山風(fēng)景區(qū)常綠闊葉樹生齒裂菌屬分類學(xué)研究及該屬種間遺傳多樣性分析姓名賈國軍申請學(xué)位級別碩士專業(yè)微生物學(xué)指導(dǎo)教師林英任201106IIABSTRACTHUANGSHANSCENICSPOTLOCATEDINSOUTHERNANHUIPROVIENCEISTHEMAINLSCAPEAREAOFOURCOUNTRYTHECOMPLEXTERRAINMILDTEMPERATUREPLENTIFULRAINFALLMAKEITSUITABLEFREPRODUCTIONOFNUMEROUSPLANTSCOCCOMYCESSPECIESAREWIDELYDISTRIBUTEDASWELLMEMBERSOFCOCCOMYCESWHICHCOLLECTEDFROMTHEEVERGREENBROADLEAVEDTREESOFHUANGSHANSCENICSPOTWERESYSTEMATICALLYSTUDIEDWITHTHEMOSTADVANCEDPOLYACTERINTEGRATEDTAXONOMYMETHODFOCUSEDONTHEACTERSOFMPHOLOGYDEVELOPMENTALBIOLOGYECOLOGYDISTRIBUTIONETCMEOVERTHEMETHODOFTHENUCLEOTIDESEQUENCESOFINTERNALTRANSCRIBEDSPACERITSWEREUSEDTOINFERPHYLOGEICRELATIONSHIPSOFTHE18COCCOMYCESSTRAINSRESULTSDETERMINEDTHEIMPTANCEOFSOMEMPHOLOGICALACTERSTHECATEGYDIVERSITYOFHOSTSONTHECLASSIFICATIONOFFUNGALSPECIESLEVELRELATIONSHIPSGEICDIVERSITYOFTHEINTERSPECIFICSTRAINSOFCOCCOMYCESWEREFURTHERCONFIRMEDSPECIMENSOFCOCCOMYCESONTHEEVERGREENBROADLEAVEDTREESCOLLECTEDFROMHUANGSHANSCENICSPOTOWNEDBYTHEHERBARIUMOFFESTFUNGIOFANHUIAGRICULTURALUNIVERSITYAAUFWERECLASSIFIEDIDENTIFIEDACCDINGTOTHETAXONOICPRINCIPLESOFSHERWOOD1980JOHNSTON1986SPOONER1990KIRKETAL200813SPECIESWEREINDENTIFIEDINCLUDINGCOCCOMYCESCYCLOBALANOPSISCDELTACHUANGSHANENSISCILLICIICOLACLEPTIDEUSCLIMITATUSCMAGNUSCMINIMUSCMUCRONATUSCMULTANGULARISCOCCULTUSCSINENSISCSYMPLOCIAMONGTHEMCMINIMUSWASANEWSPECIESTOBEPUBLISHEDLATINDIAGNOSESWEREGIVENASWELLMPHOLOGICALACTERISTICSHABITSHOSTSDISCUSSIONSWEREPROVIDEDFEACHSPECIESDICHOTOMOUSKEYTOTHESESPECIESWERECOMPLIEDINTHISTHESISFRESHMATERIALSOFCOCCOMYCESCOLLECTEDFROMHUANGSHANSCENICSPOTTIANTANGZHAINATIONALFESTPARKWANFOSHANNATIONALFESTPARKWEREISOLATEDCULTIVATEDBYTISSUEISOLATIONTECHNIQUE13PURESTRAINSWEREOBTAINEDDNAOFALLTHESTRAINSWEREEXTRACTEDDETECTEDRDNAITSREGIONSWEREAMPLIFIEDBYPCRTHENSEQUENCEDGCCONTENTOF18STRAINSWEREANALYSEDBYTHEMETHODOFMEGA41THESTATISTICALRESULTSINDICATEDTHATTHELENGTHOFITSSEQUENCESOFEACHCOCCOMYCESWASRANGEFROM436BPTO457BPTHEGCCONTENTSOFTHEITSSEQUENCESVARIEDFROM480TO516THELENGTHOFITSSEQUENCESGCCONTENTOFINTRASPECIFICSTRAINSARELOWERVARIABLETHANTHATOFINTERSPECIFICSTRAINSTHISSHOWSTHATINTERSPECIFICGEICDIVERSITYISMEABUNDANTTHANOFINTRASPECIFICAPHYLOGEICTREEOF18STRAINSWASCONSTRUCTEDBY
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      上傳時間:2024-03-12
      頁數(shù): 51
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    • 簡介:謹以此論文獻給敬愛的父母一李淵卜一二㈡。,鼻。一吐洚LIIIRLIF1LLLLLIIRLIY1926837大葉藻科的系統(tǒng)發(fā)育與大葉藻居群遺傳學(xué)研究學(xué)位論文完成日期2Q生圣旦窆旦指導(dǎo)教師簽字答辯委員會成員簽字1’___。_一/么彥’姚∥F77吻,乞乞
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      上傳時間:2024-03-12
      頁數(shù): 100
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    • 簡介:中國科學(xué)院研究生院碩士學(xué)位論文東亞特有珍稀瀕危植物連香樹的居群遺傳學(xué)研究姓名袁珊申請學(xué)位級別碩士專業(yè)植物學(xué)指導(dǎo)教師王恒昌201205ABSTRACTABSTRACTINORDERTOSTUDYTHEGENETICDIVERSITYANDSTRUCTUREOFTHEEASTASIANNATIVEANDENDANGEREDPLANTCERCIDIPHYLLUMJAPONICUMSIEBETZUCC,WEUSED11PAIRSOFAMPLIFIEDFRAGMENTLENGTHPOLYMORPHISMAFLPMARKERSTOEXAMINEATOTALOF25POPULATIONSTHATSAMPLEDFROMCHINAANDJAPANTHERESULTSSHOWEDTHATTHEPERCENTAGEOFPOLYMORPHICLOCIPWAS9725%,NEI’SGENEDIVERSITYHWAS04736ANDSHANNONINFORMATIONINDEXIWAS03514ONSPECIESLEVEL,INDICATINGAHIGHLEVELOFGENETICDIVERSITYOFTHESPECIESTHISMAYBERESULTEDFROMTHELONGEVOLUTIONARYHISTORYANDWIDELYGEOGRAPHICDISTRIBUTIONOFTHESPECIESINTHEPASTHOWEVER,ATPOPULATIONLEVEL,THEYWEREONLY6704%,0218AND03294RESPECTIVELY,SUGGESTINGALOWLEVELOFGENETICDIVERSITYTHISWASRELATIVELYCONSISTENT、析MTHERAREANDENDANGEREDSTATUSOFCERCIDIPHYLLUMJAPONICUM,WHICHDEMONSTRATEDTHATTHEGENETICVARIATIONOFSMAUPOPULATIONSTENDEDTODECREASEINTHELONGEVOLUTIONARYHISTORYTHEGENETICVARIATIONANALYSESSHOWEDTHATTHECOEFFICIENTOFGENEDIFFERENTIATIONWAS02938ANDTHEGENEFLOWWAS06010AMONGPOPULATIONSCOMBININGTHEFSTO221FROMTHEAMOVAANALYSIS,WEREVEALEDARELATIVELYHIGHGENETICVARIATIONRESULTEDFROMTHELOWGENEFLOWAMONGTHEPOPULATIONSINADDITION,WETESTEDTHEGENETICVARIATIONANDDIFFERENTIATIONOFFOURPOPULATIONSOFCERCIDIPHYLLUMJAPONICUMALONGTHEFOURRIPARIANRIVERSINTHENORTHERNANDSOUTHERNSLOPESOFTHESHENNONGJIAMOUNTAIN,ASWELLASTHEEFFECTOFSHENNONGJIAMOUNTAINASANATURALBARRIERTOTHEGENETICSTRUCTUREOFTHISSPECIESOURRESULTSSUGGESTEDTHATLARGEMOUNTAINMAYHAVESERVEDASAPHYSICALBARRIERTOGENEFLOWBETWEENPLANTPOPULATIONSTHELOWLEVELOFGENETICDIFFERENTIATIONOFPOPULATIONSBETWEENSOUTHERNANDNORTHERNSLOPEMAYHAVERESULTEDFROMTHEINTEMALCHARACTERSOFLONGDISTANCEDISPERSALABILITYOFPOLLENANDSEEDOFTHESPECIESINSUMMARY,THESTUDYONPOPULATIONGENETICDIVERSITYANDSTRUCTUREOFCERCIDIPHYLLUMJAPONICUMCALLPROVIDEFUNDMENTALINFORMATIONFORTHEFURTHERCONSERVATIONOFTHESPECIESQJQIAOJIAYUNNANANDDLLDALAOLING,HUBEIPOPULATIONS、ⅣI廿LHIGHERGENETICDIVERSITYWEREPROPOSEDTOGIVEPRIORITYTOBECONSERVEDKEYWORDSAFLP,CERCIDIPHYLLUMJAPONICUM,NATIVEANDENDANGEREDPLANTGENETICDIVERSITYGENETICSTRUCTURE
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      上傳時間:2024-03-12
      頁數(shù): 55
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    • 簡介:F』IIIIIIILLILLLLILLIIIFLL|MLLIULULEY1830520太平洋鯡和大頭鱈的群體遺傳學(xué)研究學(xué)位論文完成日期生』竺仝指導(dǎo)教師簽字答辯委員會成員簽字煎魚二
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      上傳時間:2024-03-12
      頁數(shù): 196
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    • 簡介:版權(quán)聲明任何收存和保管本論文各種版本的單位和個人,未經(jīng)本論文作者同意,不得將本論文轉(zhuǎn)借他人,亦不得隨意復(fù)制、抄錄、拍照或以任何方式傳播。否則,引起有礙作者著作權(quán)之問題,將可能承擔(dān)法律責(zé)任。通過35SLFYGR在PKL突變體中過量表達“Y,可以某種程度上逆轉(zhuǎn)由于PKL突變導(dǎo)致的開花延遲。這些結(jié)果提示,PKL很可能通過某種方式結(jié)合并調(diào)節(jié)“】,的表達,進而參與開花時間的調(diào)節(jié)。綜上所述,本課題通過RNA測序和CHIP測序的方法,從基因組水平研究擬南芥三個不同發(fā)育時期PKL所調(diào)節(jié)的下游靶基因。發(fā)現(xiàn)PKL在不同的生長時期會參與調(diào)控不同下游基因的表達,并且在這三個發(fā)育時期都存在一些特異的PKL結(jié)合位點;找到了一些受到PKL調(diào)節(jié)的包括開花相關(guān)基因包括“Y基因及其下游調(diào)控的基因在內(nèi)的下游基因,表明PKL下游基因的多樣性可能是造成PK/突變體的表型多樣性的主要原因,這一結(jié)果能夠很好地解釋P肼突變體延遲開花的表型;PKL蛋白在開花起始時結(jié)合并上調(diào)ⅡV基因、以及通過上調(diào)“】,上游基因進而上調(diào)凹】,可能是PKL調(diào)節(jié)擬南芥開花時間的重要分子機制。關(guān)鍵詞擬南芥,染色質(zhì)重塑因子,PICKLE,RNA測序,染色質(zhì)免疫共沉淀,開花2
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      上傳時間:2024-03-12
      頁數(shù): 186
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    • 簡介:學(xué)校代號10532學(xué)號B0911T0017分類號密級博士學(xué)位論文擬南芥CRY2調(diào)控光形態(tài)建成的分子遺傳學(xué)與生化分析學(xué)位申請人姓名王琴培養(yǎng)單位化學(xué)化工學(xué)院導(dǎo)師姓名及職稱劉選明教授林辰濤教授學(xué)科專業(yè)分析化學(xué)研究方向生化分析與分子生物學(xué)論文提交日期2013年6月7日THEMOLECULARGEICALBIOCHEMICALSTUDYOFCRY2INCONTROLLINGPHOTOMPHOGENESISINARABIDOPSISBYQINWANGMSHUNANUNIVERSITY2010ADISSERTATIONSUBMITTEDINPARTIALSATISFACTIONOFTHEREQUIREMENTSFTHEDEGREEOFDOCTOFSCIENCEINANALYTICALCHEMISTRYINTHEGRADUATESCHOOLOFHUNANUNIVERSITYSUPERVISPROFESSLIUXUANMINGPROFESSLINCHENTAOJUNE2013
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      上傳時間:2024-03-13
      頁數(shù): 112
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    • 簡介:廈門大學(xué)學(xué)位論文原創(chuàng)性聲明本人呈交的學(xué)位論文是本人在導(dǎo)師指導(dǎo)下,獨立完成的研究成果。本人在論文寫作中參考其他個人或集體己經(jīng)發(fā)表的研究成果,均在文中以適當方式明確標明,并符合法律規(guī)范和廈門大學(xué)研究生學(xué)術(shù)活動規(guī)范試行。另外,該學(xué)位論文為桶省穰課題組的研究成果,獲得課題組經(jīng)費或?qū)嶒炇业馁Y助,在篆H∞實驗室完成。請在以上括號內(nèi)填寫課題或課題組負責(zé)人或?qū)嶒炇颐Q,未有此項聲明內(nèi)容的,可以不作特別聲明。聲明人簽名箋3務(wù)砂N年毛月弓日目錄目錄摘要IABSTRACTIV第一章引言111荔枝螺THAIS簡介112荔枝螺的應(yīng)用價值213荔枝螺的繁殖習(xí)性214分類學(xué)研究手段和方法315遺傳標記及其在群體遺傳學(xué)和系統(tǒng)進化的應(yīng)用816國內(nèi)外研究現(xiàn)狀1217研究意義18第二章荔枝螺貝殼形態(tài)分類研究2021荔枝螺屬THAISR6DING,1798一20第三章荔枝螺齒舌形態(tài)分析3531材料與方法3532結(jié)果與分析3633討論40第四章基于COI和16SRRNA基因的荔枝螺系統(tǒng)發(fā)育分析4341材料與方法4342結(jié)果與分析4743討論60第五章中國沿岸8個地理群體的疣荔枝螺遺傳結(jié)構(gòu)分析6651材料與方法6652結(jié)果與分析6953討論78結(jié)論與研究展望81參考文獻84圖版92
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      上傳時間:2024-03-11
      頁數(shù): 113
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    • 簡介:STUDIESONTHEMOI之PHOLOGYANDGENETICDIVERSITYOFHEMIBARBUSMACULATUSINHENANPROVINCEADISSERTATIONSUBMIAEDTOTHEGRADUATESCHOOLOFHENANNORMALUNIVERSITYINPARTIALFULFILLMENTOFTHEREQUIREMENTSFORTHEDEGREEOFMASTEROFSCIENCEBYBAOZHANMENGSUPERVISORPROFLIXUEJUNMAY,2014較小,但二者與南陽、淇河群體遺傳距離較大。6本研究表明,DNA條形碼適用于胸亞科魚類,基于對絢亞科7種10個體的COI基因序列分析,發(fā)現(xiàn)在觴亞科魚類中COI基因序列可以較好地區(qū)分各物種。因此,COI基因序列對該亞科的分類是一個行之有效的DNA條形碼序列。關(guān)鍵詞鲴I,形態(tài)特征,分子條形碼技術(shù),遺傳多樣性II
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      上傳時間:2024-03-12
      頁數(shù): 60
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    • 簡介:基于比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的枯草芽比較基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)的枯草芽孢桿菌桿菌過量積累過量積累核黃素核黃素遺傳遺傳機理機理研究研究INSIGHTSINTOGEICACTERISTICSOFRIBOFLAVINOVERPRODUCINGBACILLUSSUBTILISBASEDONCOMPARATIVEGENOMICSTRANOMICS國家重點基礎(chǔ)研究發(fā)展計劃項目(973計劃)2011CBA00804;國家自然科學(xué)基金項目NSFC21206112;國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)2012AA022103;一級學(xué)科化學(xué)工程與技術(shù)學(xué)科專業(yè)生物化工研究生王光路指導(dǎo)教師趙學(xué)明教授天津大學(xué)化工學(xué)院二零一四年十月中文摘要中文摘要本課題選取核黃素合成基礎(chǔ)菌株為研究對象,通過比較基因組與比較轉(zhuǎn)錄組分析,篩選出潛在正向突變,進一步利用無痕等位基因置換技術(shù),逆向代謝工程重構(gòu)突變菌株,考察不同突變對于核黃素合成貢獻度。對鑒定的正向突變進行機理分析,闡述導(dǎo)致枯草芽孢桿菌過量合成核黃素的遺傳機制。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明,和對照菌株相比,BSUBTILIS24PMX45菌株共有945個差異表達基因,表達水平上調(diào)的基因有483個,表達水平下調(diào)的基因有462個。進一步數(shù)據(jù)分析發(fā)現(xiàn),BSUBTILIS24PMX45核黃素合成途徑表達水平較高,但嘌呤代謝途徑、一碳單位代謝相關(guān)途徑表達水平低。同時,中心碳代謝途徑和葡萄糖轉(zhuǎn)運系統(tǒng)基因表達水平較低,這些可能是該菌葡萄糖利用速率低、生長速度慢和核黃素合成速率較低的原因。結(jié)合全基因組突變分析與比較轉(zhuǎn)錄組結(jié)果,通過無痕等位基因置換技術(shù),鑒定出7個正向突變RIBC(G199D)、RIBD(G39A)、PURA(P242L)、CCPN(A44S)、YVRH(R222Q)、YHCF(R90)、YWAA(Q68)。將正向突變以及游離質(zhì)粒PMX45重構(gòu)至工程菌株BSW54PMX45,可達到BSUBTILIS24PMX45菌株80的核黃素合成水平。其中,RIBC(G199D)、RIBD(G39A)顯著解調(diào)了核黃素操縱子的表達。PURA(P242L)導(dǎo)致了腺苷琥珀酸合成酶活性喪失,導(dǎo)致IMP向AMP合成受阻,菌體過量合成GMPGDPGTP,提高了核黃素合成前體物的供給水平。CCPN(A44S)喪失部分抑制活性,解調(diào)了糖異生代謝途徑,提升了戊糖磷酸途徑的通量和前體物核酮糖5磷酸的供給。雙組分系統(tǒng)轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)子基因YVRH(R222Q)突變顯著提升核黃素合成能力。RTPCR實驗表明,受其負調(diào)控LYTABC的表達水平明顯上調(diào),說明YVRH(R222Q)部分丟失功能。轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表明,LYTC(NACETYLMURAMOYLLALANINEAASE)過表達導(dǎo)致菌株嘌呤合成途徑顯著增強,提高了核黃素合成能力,推測LYTC的過表達改變了細胞壁完整性和滲透性,并進一步解調(diào)了嘌呤合成途徑。在谷氨酸棒桿菌工程菌株△4PPC中過表達NACETYLMURAMOYLLALANINEAASE可顯著提高5氨基乙酰丙酸合成能力,說明這種作用機制對于提高生物基產(chǎn)品的產(chǎn)量可能具有一定普遍適用性。關(guān)鍵詞關(guān)鍵詞枯草芽孢桿菌;核黃素;轉(zhuǎn)錄組測序;逆向代謝工程;突變分析;
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      上傳時間:2024-03-12
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    • 簡介:中圖分類號Q3窆UDC570碩士學(xué)位論文學(xué)校代碼Q三三密級公玨過量碘對線蟲生長發(fā)育影響的遺傳學(xué)研究GENETICANALYSISOFTHEBIOLOGICALEFFECTOFEXCESSIODIDEINCELEGANS作者姓名學(xué)科專業(yè)學(xué)院系、所指導(dǎo)導(dǎo)師許昭發(fā)遺傳學(xué)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)國家重點實驗室馬龍教授論文答辯日期幽答辯委員會主席翅孕I中南大學(xué)二0一四年六月碩士學(xué)位論文中文摘要摘要過量碘對線蟲生長發(fā)育影響的遺傳學(xué)研究碘是生物體必需的一種微量元素,在高等動物中主要用于合成甲狀腺激素,調(diào)節(jié)代謝。碘缺乏和過量都會導(dǎo)致嚴重的后果,碘缺乏是甲狀腺功能低下和智力發(fā)育遲鈍的一個主要原因,而碘過量是高碘性甲狀腺腫、甲狀腺功能亢進等諸多甲狀腺疾病的主要風(fēng)險因素。然而,碘過量致病的分子機制尚不明了。相對哺乳動物,碘在其他動物上的研究也很少,秀麗線蟲CAENORHABDITISELEGANS是一種常用的、重要的模式動物,而碘在秀麗線蟲上幾乎沒有研究。目的研究過量碘對秀麗線蟲生長發(fā)育的影響,了解線蟲應(yīng)對過量碘的基因及分子機制。方法在線蟲培養(yǎng)基中加入不同濃度的碘,培養(yǎng)野生型線蟲N2,觀察過量碘對線蟲生長發(fā)育的影響。通過EMSETHYLMETHANESULFONATE正向遺傳篩選獲得相關(guān)突變體,利用SNPSINGLENUCLEOTIDEPOLYMORPHISM遺傳作圖分析定位突變所在染色體及區(qū)間位置,并克隆突變基因。用DCFDA2’,7DICHLORODIHYDROFLUORESCEINDIACETATE對不同品系線蟲體內(nèi)活性氧族REACTIVEOXYGENSPECIES,ROS水平進行檢測。結(jié)果我們在線蟲培養(yǎng)基里加入不同濃度的碘化鈉,發(fā)現(xiàn)野生型線蟲呈現(xiàn)一種碘濃度依賴的負相關(guān)生長模式,當濃度達到5MM及以TT
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      上傳時間:2024-03-12
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    • 簡介:BYZHANGNINGNINGADISSERTATIONSUBMITTEDTOUNIVERSITYOFCHINESEACADEMYOFSCIENCESINPARTIALFULFFILMENTOFTHEREQUIREMENTFORTHEDEGREEOFMASTEROFSCIENCEKUNMINGINSTITUTEOFBOTANYCHINESEACADEMYOFSCIENCESMAY2014研究生學(xué)位論文版權(quán)使用授權(quán)聲明本人完全了解并同意遵守中科院昆明植物研究所有關(guān)保留、使用學(xué)位論文的規(guī)定,即研究所有權(quán)保留送交論文的復(fù)印件和電子文件,并提供論文的目錄檢索及借閱、查閱研究所可以公布論文的全部或部分內(nèi)容,可以將本學(xué)位論文的全部或部分內(nèi)容編入有關(guān)數(shù)據(jù)庫進行檢索,可以采用影印、縮印或其它復(fù)制手段保存和匯編本學(xué)位論文。保密的論文在解密后遵守此規(guī)定。作者簽名導(dǎo)師簽名時間刀仫J27
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      上傳時間:2024-03-13
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    • 簡介:針興號。Q逛B⑧皂。舅I蒸拳杰。羹博士學(xué)位論文學(xué)號皂2QL墊』叢六儲礴越堿摯屬%忽種細胞遺傳學(xué)與螺J紊統(tǒng)避花研究。一指導(dǎo)熬I師攀季K專業(yè)研,菇、努向L‘●‘論文答辯峙閘楊賻容周永紅J教授橙物學(xué)植物分類翱熹統(tǒng)進化20T7年5月22日答辯委員會主席余懋群巾科院成都生物所∞。H車受鞠ADISSERTATIONPRESENTEDTOSICHUANAGRICULTURALUNIVERSITYINFULFILLMENTOFTHEREQUIREMEMFORTHEDOCTORDEGREEOFBOTANYCYTOGENETIC,PHYLOGENETICANDEVOLUTIONARYSTUDIESONHQPLOIDEOPOACEAESTUDIES0NHEXAPLOIDEVMUSLOACEAETRITICEAEBYYANGCAIRONGDIRECTEDBYPROFZHOUYONGHONGDRZHANGHAIQINDRBERNARDRBAUMUNIVERSITYOFOTTAWA,CANADADRDOUGLASAJOHNSONUNIVERSITYOFOTTAWA,CANADAMAY2017
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    • 簡介:關(guān)于基因型一表型相關(guān)問題的統(tǒng)計遺傳學(xué)及計算生物學(xué)分析陳文海指導(dǎo)老師谷迅教授復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院復(fù)旦大學(xué)博士學(xué)位論文關(guān)于基因型表型相關(guān)問題的統(tǒng)計遺傳學(xué)及計算生物學(xué)分析目錄摘要IABSTMCTIII前言L第一章文獻綜述31I引言312FISHER幾何模型及表型進化的選擇模型313基因多效性的度量4131多效性的直接計算及問題4132利用數(shù)學(xué)模型通過其它觀測來間接計算S14利用數(shù)學(xué)模型來間接計算基因多效性GU方法簡介一6141蛋白質(zhì)序列進化模型6142選擇強度與模型分類914_3蛋白質(zhì)序列的進化速率11144估計基因多效性和選擇強度13145基因多效性的初步分析16IA6對GU方法的幾點評注I715胞吐作用1716參考文獻21第二章關(guān)于基因多效性概念和統(tǒng)計估計問題的進一步探討鴣21引言2822HL模型的簡要介紹2923多層次基因型表型映射模型及最小多效性的概念3324基因型表型映射的線性模型及其秩的定義3424。I單映射情景34242線性變換映射模型從一步映射推廣到多步映射3S25基因型表型映射下秩的估計36251穩(wěn)態(tài)選擇模型下的自然選擇系數(shù)37252MARTINLENORMAND方法37253GU方法3826有效最小多效性對于X的一種各選解釋38261MARTINLCNORMAND方法RL對應(yīng)于隨機突變39262GU方法39263PIGANCAUWALKCR方法3927數(shù)據(jù)分析和測試。40271GU方法對蛋白質(zhì)序列的應(yīng)用一40272GU方法對核苷酸序列的應(yīng)用412S基于MATLAB的計算流程~42281有效基因多效性丘43282估計步驟44283有效選擇強度44284有效基因多效性的糾偏估計4S29計算機模擬46291突變秩對估計的影響46
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      上傳時間:2024-03-11
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    • 簡介:SICHUANAGRICULTURALUNIVERSITYMASTERDISSERTATIONTHEPHYLOGENETICANDGENETICDIVERSITYSTUDIESOFAGROPYRONCRISTATUMLGAERTNERPOACEAETRITICEAEBASEDONMORPHOLOGYANDGBSSIGENE一一,一ZHUOXIAOFENGBOTANYDIRECTEDBYPROFXIAOLIWANGDRLINASHAYAAN,SICHUAN,PRCMAY,2015摘要LULLLLLLLLLLLLLLLLLMIILRLLLLLLLLLLLLFJ0126769冰草AGROPYRONCRISTATUMLGAERTNER為禾本科POAEEAE小麥族TRITIEEAE多年生草本植物,是冰草屬的模式種,廣泛分布于歐亞大陸的北亞熱帶和溫寒帶等地區(qū)。冰草是草原草甸的重要組成成分,對生態(tài)環(huán)境的改善、水土保持有著重要作用冰草莖葉柔嫩、飼口性好、生長迅速,具有很高的飼用價值;冰草具有抗旱、抗寒、耐鹽堿以及對各種病蟲害的抗性,是小麥遺傳改良的重要資源。目前,對冰草的研究主要集中在生態(tài)建設(shè)、遺傳育種等方面,而對于其系統(tǒng)發(fā)育、居群遺傳結(jié)構(gòu)、分支系統(tǒng)學(xué)方面的研究還未見報道。本研究選取47個冰草植物的14個形態(tài)性狀,63個冰草植物以及25個其近緣的二倍體屬種植物的GBSSI基因序列,從形態(tài)學(xué)和分子系統(tǒng)學(xué)兩方面對其進行系統(tǒng)發(fā)育重建,探討冰草及其近緣屬植物間的系統(tǒng)關(guān)系,冰草居群間的親緣關(guān)系、遺傳分化、形態(tài)變異以及遺傳結(jié)構(gòu),冰草植物的遺傳多樣性。研究結(jié)果表明1冰草在物種水平上及居群水平上均表現(xiàn)出豐富的遺傳多樣性7【O05。冰草居群間遺傳分化系數(shù)為0058,居群內(nèi)遺傳的多樣性是導(dǎo)致冰草物種遺傳多樣性豐富的主要因素。2分子系統(tǒng)樹中,冰草分別與EREMOPYRUMDISTANS、AGROPYRONMONGOLICUM以及TAENIATHERUMCAPUTMEDUSAE聚在一起,支持P染色體組與F染色體組有較近的親緣關(guān)系。3中亞冰草居群分布在分子系統(tǒng)樹及分支系統(tǒng)樹的各個分支中,中亞居群與歐洲、東亞的遺傳距離較近,推測中亞可能是冰草的生物多樣性起源中心。青藏高原冰草居群與中亞、歐洲居群遺傳距離較遠,且在系統(tǒng)發(fā)育樹中大多形成獨立的分支,推測在長期的演化歷史進程中,青藏高原冰草居群已經(jīng)處于相對獨立的狀態(tài)。4中亞冰草居群在進化歷史過程中可能經(jīng)歷過明顯的群體擴大和定向選擇事件TAJIMASD185001,P005。歐洲、東亞居群中性檢測值均為負值,且差異不顯著,說明歐洲與東亞冰草居群未偏離中性進化模型,居群相對結(jié)構(gòu)穩(wěn)定。關(guān)鍵詞分支分析;分子系統(tǒng)學(xué);形態(tài)學(xué)性狀;GBSSL基因;冰草;遺傳多樣性
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      上傳時間:2024-03-13
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    • 簡介:分類號密級UDC編號工學(xué)碩士學(xué)位論文結(jié)合表觀遺傳學(xué)的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控功能分析方法研究碩士研究生董增超指導(dǎo)教師馮偉興教授學(xué)科、專業(yè)檢測技術(shù)與自動化裝置論文主審人王科俊教授哈爾濱工程大學(xué)2013年01月CLASSIFIEDINDEXUDCADISSERTATIONFTHEDEGREEOFMENGRESEARCHOFANALYSISMETHODTOINVESTIGATEREGULATYFUNCTIONOFTRANIONFACTWITHEPIGEICFACTSCIDATEDONGZENGCHAOSUPERVISFENGWEIXINGACADEMICDEGREEAPPLIEDFMASTEROFENGINEERINGSPECIALTYDETECTIONTECHNOLOGYAUTOMATIONEQUIPMENTDATEOFSUBMISSIONJAN2013DATEOFALEXAMINATIONMAR2013UNIVERSITYHARBINENGINEERINGUNIVERSITY
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      上傳時間:2024-03-12
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