重慶地區(qū)HBV基因型與臨床相關(guān)性分析及HBV群體遺傳學(xué)研究.pdf

1、目的：了解重慶地區(qū)HBV基因型分布特征，探討各基因型與HBV感染者年齡、性別、肝功能狀態(tài)、HBeAg陽(yáng)性率、病毒復(fù)制水平、臨床用藥、臨床表型及HBVS基因突變的關(guān)系，為本地區(qū)診治和預(yù)防乙型肝炎提供理論依據(jù);研究HBV的群體遺傳學(xué)，計(jì)算重慶各地區(qū)HBV群體遺傳結(jié)構(gòu)，推測(cè)某些地區(qū)是否存在HBV可能爆發(fā)的威脅。
　　方法：選取重慶8個(gè)地區(qū)HBsAg陽(yáng)性的HBV感染者768例，提取各感染者電子病歷中的人口統(tǒng)計(jì)學(xué)信息和診斷治療數(shù)據(jù)，應(yīng)用PC

2、R和直接測(cè)序法獲得HBV S基因序列，運(yùn)用NCBI在線軟件genetyping及軟件MEGA6.0將HBV S基因序列和在NCBI上下載的21條A-H型標(biāo)準(zhǔn)序列進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的構(gòu)建，分析HBV基因型;運(yùn)用生物信息軟件分析S基因突變位點(diǎn)，通過(guò)統(tǒng)計(jì)學(xué)方法探討基因型與臨床特征及S基因突變的相關(guān)性;應(yīng)用群體遺傳學(xué)方法，對(duì)不同地區(qū)不同基因型的HBV群體進(jìn)行群體遺傳學(xué)分析，探討重慶各地區(qū)不同基因型HBV的擴(kuò)張情況。
　　結(jié)果：⑴768例HBs

3、Ag陽(yáng)性血清標(biāo)本中，成功測(cè)出HBV S基因序列的有528條。其中B型346例(65.53％)，C型181例(34.28％)，D型1例(0.19％)，未見(jiàn)其他基因型；⑵B型和C型在性別、年齡、HBV DNA載量及臨床用藥方面差異不大，沒(méi)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＞0.05)；⑶C型HBV感染者ALT異常值(＞40IU/L)的比例及HBeAg陽(yáng)性率明顯高于B型(P＜0.05)。LC/HCC組中C型的比例高于ASC組和CHB組(P＜0.05)，ASC組

4、和CHB組中B型比例高于LC/HCC組中B型比例(P＜0.01)；⑷B型和C型HBV S基因不同細(xì)胞表位均存在大量突變，B型主要突變類型為I110L、P120T、K122R、T126A/S、P127T、Q129H/R、M133L、T140N;C型突變類型主要有Y100C、Q101R、T113S、S114T、I126T/N/S、G130N、F134L、G131N、S143T。P120T、K122R為B型特異性突變，T113S為C型特異性突

5、變；⑸在HBsAg MHRB型HBV株有140例(140/346)發(fā)生了突變，C型有84株(84/181)發(fā)生了突變，B型和C型的突變比例無(wú)明顯差異(P＞0.05);突變存在單突變和多突變，C型多突變比例38.1％(32/84)高于B型17.9％(25/140)，具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P＜0.01)；⑹比對(duì)后的HBV S基因序列中，346條B型531bp S基因有189個(gè)突變位點(diǎn)，250個(gè)hap，h為0.978，各地區(qū)從0.895-0.999

6、不等，π為0.01644，各地區(qū)從0.00694-0.02628不等;181條C型525bpS基因有161個(gè)突變位點(diǎn)，163個(gè)hap，h為0.999，各地區(qū)從0.992-1不等，π為0.02051，各地區(qū)從0.01788-0.02604不等；⑺各地區(qū)B型和C型HBV群體的BSP顯示貝葉斯天界線呈上升趨勢(shì)，中性檢驗(yàn)值(Tajima's D值與Fu's Fs值)均為負(fù)值，大部分地區(qū)的錯(cuò)配分布為單峰倒鐘形分布，綜合分析表明重慶地區(qū)HBV群體近

7、10年經(jīng)歷了一個(gè)擴(kuò)張過(guò)程，有的地區(qū)甚至擴(kuò)張了10倍，只有少部分地區(qū)的C型擴(kuò)張不明顯（黔江、合川、沙坪壩區(qū)）。
　　結(jié)論：①B型為重慶地區(qū)的優(yōu)勢(shì)基因型，占65.53％；②C型比B型具有更強(qiáng)的致病力，容易引起肝硬化及肝細(xì)胞癌；③HBVS基因不同表位均存在大量突變，這些突變的病毒抗原性及免疫原性可能發(fā)生改變，感染HBsAb陽(yáng)性人群；④C型多突變率比例高于B型，多突變可能會(huì)影響HBV的致病性，影響乙肝患者的治療及預(yù)后；⑤B型和C型HBV群