大白菜抽薹開花時(shí)間與SSR和InDel標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、大白菜(Brassicacampestrisssp.pekinensis)原產(chǎn)中國,屬十字花科蕓薹屬蕓薹種。抽薹開花時(shí)間是重要的農(nóng)藝性狀,我們有必要在分子水平探討大白菜抽薹開花時(shí)間的變異特點(diǎn)和遺傳基礎(chǔ),從而進(jìn)一步發(fā)掘優(yōu)異等位基因資源。依靠單一標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行種質(zhì)鑒別的支持率、分辨率有限,因此,本研究利用基因組上均勻分布的30個(gè)SSR標(biāo)記和27個(gè)InDel標(biāo)記,對(duì)190份大白菜種質(zhì)材料進(jìn)行群體結(jié)構(gòu)分析,并系統(tǒng)地進(jìn)行抽薹開花時(shí)間與分子標(biāo)記的關(guān)聯(lián)

2、分析。群體結(jié)構(gòu)分析結(jié)果有助于充分挖掘親緣關(guān)系較遠(yuǎn)的種質(zhì)資源,進(jìn)而利用適宜的自交系材料試配組合,為選育優(yōu)良大白菜品種,提高育種效率提供理論依據(jù),也是關(guān)聯(lián)分析的基礎(chǔ);關(guān)聯(lián)分析可以明確群體內(nèi)不同基因型中所攜帶的等位基因?qū)δ繕?biāo)性狀的貢獻(xiàn),解釋豐富表型變異的遺傳基礎(chǔ)。結(jié)果如下:
　　 1.從199對(duì)隨機(jī)SSR引物中篩選出多態(tài)性高的引物24對(duì),從36對(duì)與開花時(shí)間相關(guān)的特異SSR引物中篩選出多態(tài)性高的引物6對(duì),從100對(duì)InDel引物中篩選出

3、多態(tài)性高的引物27對(duì)。其中24對(duì)隨機(jī)SSR引物共檢測出76個(gè)等位基因,平均每對(duì)引物檢測到等位基因3.2個(gè),變幅為2～6個(gè);6對(duì)特異SSR引物共檢測出15個(gè)等位基因,平均每對(duì)引物檢測到等位基因2.5個(gè),變幅為2～4個(gè);27對(duì)InDel引物共檢測出76個(gè)等位基因,平均每對(duì)引物檢測到等位基因2.8個(gè),變幅為2～7個(gè)。
　　 2.將30對(duì)SSR引物和27對(duì)InDel引物產(chǎn)生的167個(gè)等位基因標(biāo)記用于群體結(jié)構(gòu)分析,Structure分析表

4、明,所選的190份大白菜材料可分為3個(gè)亞群-S1,S2和S3。S1由66份材料組成,全部為自交系;S2由72份材料組成,包括10份自交系和62份F1;S3由52份材料組成,包括4份自交系和48份F1。
　　 3.S1中材料的抽薹天數(shù)主要集中在72～99天,開花天數(shù)主要集中在83～109天;S2中材料的抽薹天數(shù)主要集中在80～99天,開花天數(shù)主要集中在90～109天;S3中材料的抽薹天數(shù)主要集中在72～89天,開花天數(shù)主要集中在8