榨菜SSR遺傳圖譜的構(gòu)建及瘤狀莖膨大性狀的QTL定位.pdf

1、榨菜(Brassicajuncea(L.) Czem.et Coss.var.tumida Tsen et Lee）在分類學(xué)上稱為莖瘤芥，是以膨大的肉質(zhì)瘤狀莖為主要產(chǎn)品器官的十字花科蕓薹屬芥菜類蔬菜。目前對(duì)榨菜瘤狀莖膨大性狀的研究主要集中在環(huán)境調(diào)控和細(xì)胞相關(guān)基因的分子調(diào)控上，對(duì)其膨大性狀的遺傳規(guī)律及控制瘤狀莖膨大性狀的基因定位方面的研究，才剛剛起步。本研究利用榨菜轉(zhuǎn)錄組序列，開發(fā)EST-SSR分子標(biāo)記;以榨菜（莖膨大）和分蘗芥（莖不膨大

2、）為親本，通過雜交獲得F2代并構(gòu)建作圖群體，利用SSR分子標(biāo)記構(gòu)建遺傳圖譜;并利用該圖譜對(duì)榨菜瘤狀莖的膨大性狀進(jìn)行QTL定位。主要結(jié)果如下:
　　(1)利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序得到的榨菜EST序列信息，運(yùn)用SSRLocatorⅠ vs.1軟件進(jìn)行SSR位點(diǎn)掃描和SSR引物設(shè)計(jì)，共搜索得到8777個(gè)SSRs，并成功地對(duì)其中的6127個(gè)SSR位點(diǎn)進(jìn)行了引物設(shè)計(jì)。將引物設(shè)計(jì)成功的SSR標(biāo)記按序命名成BjS SR0001-BjS SR6127，并驗(yàn)

3、證了開發(fā)得到的SSR標(biāo)記具有良好的通用性。
　　(2)以莖膨大的榨菜和莖不膨大的分蘗芥菜為親本，通過雜交獲得的F2代構(gòu)建作圖群體，利用開發(fā)的EST-SSR分子標(biāo)記構(gòu)建了一張由116個(gè)SSR分子標(biāo)記組成，平均圖距為17.92cM，覆蓋基因組長(zhǎng)度為2061.0cM，包含17個(gè)連鎖群的芥菜遺傳圖譜。
　　(3)采用復(fù)合區(qū)間作圖法對(duì)控制榨菜瘤狀莖膨大的3個(gè)性狀莖重、橫徑及縱徑進(jìn)行了QTL定位。檢測(cè)到4個(gè)控制莖重的QTL位點(diǎn)(SW1-