蓖麻遺傳圖譜構(gòu)建及株高性狀的QTL定位分析.pdf

1、本研究用YC2×YF1組合的F2群體構(gòu)建了蓖麻的分子遺傳圖譜,利用基于混合線性模型的復(fù)合區(qū)間作圖法(MCIM)的多模型定位策略,在YC1×YF1、YC2×YF1兩個(gè)高矮桿組合的F2群體中對(duì)株高性狀進(jìn)行了QTL定位分析,主要結(jié)果如下:
　　1.共利用1000對(duì)SSR、381對(duì)SRAP和480對(duì)SSRAP組合引物,在雙親和F1間分別檢測(cè)到三種標(biāo)記的237、25、28個(gè)多態(tài)性位點(diǎn),多態(tài)性位點(diǎn)百分率分別是25.2％、6.6%、8.5%;三

2、種標(biāo)記擴(kuò)增片段長(zhǎng)度分別為100~500 bp,100~800 bp,100~600bp;另檢測(cè)出1對(duì)ISSR和3個(gè)形態(tài)標(biāo)記,共計(jì)294個(gè)遺傳標(biāo)記用于F2群體的遺傳圖譜構(gòu)建。
　　2.利用Mapmaker/Exp3.0構(gòu)建了一張蓖麻分子遺傳圖譜,該圖譜包含19個(gè)連鎖群,230個(gè)分子標(biāo)記(203個(gè)SSR、14個(gè)SRAP、9個(gè)SSRAP、1個(gè)ISSR和3個(gè)形態(tài)標(biāo)記),覆蓋全基因組的2751.3 cM,標(biāo)記平均間距11.9 cM,連鎖群所

3、含標(biāo)記數(shù)幅度為2～42個(gè),連鎖群遺傳距離長(zhǎng)度為11.4～499.0 cM,連鎖群標(biāo)記密度變幅為5.7 cM(LG11)~13.7 cM(LG4),標(biāo)記RCM219和RCM720間的遺傳距離最大為29.7 cM,RCM855與ISSR836為兩共分離標(biāo)記,圖譜中共有22處gap(≥20 cM)。對(duì)蓖麻基因組全長(zhǎng)進(jìn)行估算其數(shù)值為3370 cM,意味著該遺傳圖譜覆蓋基因組全長(zhǎng)的81.6%。
　　3.蓖麻株高性狀相關(guān)、回歸和QTL定位分析

4、表明:株高與主穗位高、主莖節(jié)長(zhǎng)和主莖莖粗之間顯著正相關(guān),但與主莖節(jié)數(shù)不相關(guān);主穗位高與主莖節(jié)數(shù)、主莖節(jié)長(zhǎng)和主莖莖粗之間顯著正相關(guān);主莖節(jié)數(shù)與主莖節(jié)長(zhǎng)之間顯著負(fù)相關(guān)。
　　4.利用QTLNetwork2.0軟件在YC2×YF1的F2群體中檢測(cè)到株高、主穗位高、主莖節(jié)數(shù)、主莖節(jié)長(zhǎng)和主莖莖粗的5、4、6、3和2個(gè)QTL,分別解釋了45.9%、45.3%、66.1%、55.4%和12.6%的總變異。在YC1×YF1的F2群體中檢測(cè)到3、4